本作以全住宿制高中为舞台，讲述被外星人绑架的5名高中生在探索学校真相的同时，发现足以改变地球未来的“宇宙秘密”的故事。

Kyung-woo自小就有视障问题，所以对UFO感到好奇的她永远不能看见自己想见的东西。在辅导中心工作的她因为夜归，每晚都乘搭尾班巴士回家。而驾驶这尾班巴士的便是PARKSang-hyun。 　　失恋过的Sang-hyun日间是一名巴士司机，但放工后便在自己的家仿如电台唱片骑师般主持节目。有时他会因独自主持节目而感到寂寞。Sang-hyun和Kyung-woo本来并不相识，然而某一晚Kyung-woo坐巴士坐到总站仍未下车，Sang-hyun便上前唤醒她……

在波兰瓦尔米亚地区的特鲁斯卡西发生一起疑似UFO降落事件后，两名男子——一位过气的电视明星和一位外星生命爱好者——展开了一场智力探索，试图揭开外星生物的起源之谜。他们的争论吸引了周围的人纷纷卷入其中。在这两位主角努力向世界证明各自理论的同时，一位强大的政治家却利用超自然现象来攫取对国家的权力。

肖恩·莱德是80年代另类摇滚乐队快乐星期一的主唱。自从在15岁时目睹了一起UFO事件后，他就对UFO产生了浓厚的兴趣。他曾说过，“并非是我想要相信，而是我非信不可”。在这个备受期待的系列纪录片《肖恩·莱德探索UFO》中，为了调查潜在的外星人目击事件，他飞往世界的另一端，来到南美洲的UFO之都——智利，寻找那些研究UFO的前沿人士，通过他们去发现其他人如何应对这一最为神秘的现象。他与UFO学的权威人士、将军、科学家、以及被绑架者本人会面，从他们的所言中分辨虚实。

在古都镰仓的一所中学，升上初中二年级的关健二，在早晨的海边，同将爱慕之意埋藏于心底的学生会书记春河香穂梨开始了初次的对话。与他是青梅竹马又是香穂梨的好友的凉浦夏希，怀着复杂的心情在一旁看着他们。然后，健二在高台上与沐浴着樱花花瓣，仿佛能操纵风力的少年遭遇。这个少年看着有几分不可思议，而和他的再会也比预想中的更早——这个少年正是转到健二班上的转校生——京极龙一，在健二，夏希，佳惠梨所在班级出现的京极，马上融入班级的氛围，却又好似浮现出一丝与周围气氛不相容的东西。佳惠梨开始悄悄的注意着京极。突如其来，学园不可思议的突发事件开始了。事件不仅牵涉到健二、夏希、佳惠梨，学生会的各方面，班主任，健二的祖父关耕儿，甚至连休学中的山际百合子一行人也被卷入其中。各种各样的心思开始浮出水面，健二和夏希的距离感也开始发生显而易见的变化。最后，京极究竟是谁？而学园里又正发生着什么……

故事以凹凸学园的初中部与高中部为舞台，描写围绕着刚升入高一的新生——金与他身边的同学之间，轻松有趣的搞笑向日常生活。凹凸学园里有着形形色色性格各异、古怪却也不失可爱的学生，而本作采用平行式的单元小故事讲述，用萌系Q版人物、声优的诙谐演出及别具一格的画面效果，将最轻松真实的学园生活展现给观众。

"在某个世界泡中，武装人偶与死士的冲突从未间断过。伴随着二者之间的冲突不断升级，世界泡的稳定性正逐渐降低。为了拯救这个即将崩坏的世界，人类成立了专门用来管理与控制人偶的组织。为了掩盖黑暗的真相，人类特地给组织取了一个非常可爱的名字——「人偶学园」……——啊哈哈，开玩笑的，怎么可能是那样呢？"

故事发生在巡之丘学园中，丈枪由纪天真可爱，是名副其实的开心果。惠飞须泽胡桃踏实可靠，她的坚强和元气影响了身边的每一个人。若狭悠里温柔坚强，是大家心目中稳重的靠山。直树美纪外表冷漠，但内心的热情不容忽视。这些可爱的孩子们共同组成了“学园生活部”，每天都在进行愉快的部活。空无一人的校园，破败不堪的教室，四处游走的行尸，究竟哪一个是幻想，哪一个是真实？巨大的灾难面前，少女们将恐惧化作力量，尽各自的所能，目的只有一个，那就是活得更久，更快乐。

以县内顶级实力而自豪的男子学校，私立蔷薇门高中。转学到那里的主人公，与众多的猛者们相遇了。 穿越校门后，见到的是帅哥—— 无法的教师、足球部的队长、时隔七年再次相遇的儿时玩伴，等等……充满个性的人们与主人公所展开的友情、爱情、纠葛也是多种多样……激烈的心意相互交错的学园恋爱物语。

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