这是一部描绘非线型历史的神话故事。 　　人类大战持续了将近50年，世界由此分化为大亚细亚连邦共和国和欧共体两大阵营。持久战结束后，大亚细亚连邦共和国终于取得了胜利，并统治了欧洲和亚洲部分大陆，但战利品并不可观，除了土地的荒废，人心的慌乱外，还残留了很多战争后遗症。比如一些在战场上使用过的杀伤性化学武器、细菌武器、核武器等等。 　　这一情形告诉我们拯救人类、拯救社会、拯救世界刻不容缓，人类处于即将崩溃的状态。怎样去面对这一切？怎样去寻找重生的道路？社会呼唤有志之士勇敢地战出来给这个被战争荒废了世界寻找一个公道。在这样危急的时刻，东博士提倡“完整地制造出人类所有器官的新造细胞”理论，这一理论在学术会上得到了认可。东博士的爱妻绿已久病卧床不起，为了把妻子从死神手中夺回来，东博士也必须完成这个研究。但社会保健部门从研究初期开始就企图独吞这一成果，为了顾全大局东博士在不断让步的情况下，着手开始这项研究。在东博士的呕心沥血的研究下，新造人类终于诞生。但原本是以拯救人类为目的制造的“新造细胞”到头来却于人类为敌，把人类赶进血的世界……

于2001年10月开始放送的人造人009系列TV动画第三作，共51话的彩色动画，通称平成版。 其中1-27话为バトルアライブ（Battle Alive）篇，28-48话为第二章 地上より永遠に（从现在到永远），49-51话为完結編〜Conclusion God's War〜序章〜。此外另有总集篇47.5话黄泉的群像。到48话为止即可视为完整的一个故事，关于完结篇之后会另外详细介绍。 平成版是以忠实于漫画原作为方针制作的，以原作的起点“诞生篇”为开头、“地下帝国黄泉篇”为动画结局，中间则包含了其他原作知名中篇及若干短篇改编而成的动画。 但由于动画播出时的2001年与原作开始的年代设定（1960年代）相比，世界局势发生了巨大的变化，所以动画相应地改动了一些设定，比如001-004号的“第一世代”设定就是原作所没有的。