作品改编自经典同名游戏。千年前，神将飞蓬与魔尊重楼于新仙界中大战，神剑“照胆”跌落人间，飞蓬被贬下凡。千年后，蜀山锁妖塔震荡，获得魔剑的飞蓬转世——景天，与唐雪见、徐长卿及紫萱几人开始了一场为收集五灵珠封印锁妖塔的冒险。

《仙剑奇侠传三》故事发生在《仙剑》第一代的五十年前，那时候，李三思刚刚发出赤子的第一声啼哭；巫后还是襁褓中的婴儿，而剑圣，则还没有拜入蜀山修仙…

神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手，一直难分胜负，两人逐渐有惺惺相惜之意。重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗，一较高下，飞蓬碍于神界天规而犹豫再三，最终经不起重楼诱惑而答允。 两人势均力敌，比试旷日持久，最终惊动了天庭，天帝派兵捉拿飞蓬问罪，飞蓬因感知到追兵将至而分心，佩剑被重楼打落人间而落败…… 飞蓬被神界问罪贬为人，经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。同时，重楼自魔界窥探人间，偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡，心中动念想要帮助景天，于是来到人间，滋扰蜀山，想要帮飞蓬找回佩剑，无意中毁坏了锁妖塔，偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。 景天得到魔剑的同时，结识了唐门小姐雪见，从此改变了自己的生活。一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中，而后遇到蜀山弃徒长卿及其未婚妻『紫萱』，走上了协助蜀山寻找五灵珠，封印锁妖塔的漫漫征途。一直隐藏在魔剑中的鬼魂化身而出，竟然是景天前世龙阳的妹妹龙葵。几个人的情爱纠葛，生离死别反复交织纠缠，雪见的离奇身世，紫萱不为人知的秘密，龙葵长久以来的心中愿望……伴随着人类与妖界死生存亡的争斗，而其实人的欲望，才是所有纷争的本源。

本剧讲述了渝州城永安当的小伙计景天和唐门大小姐雪见受到两人随身玉佩的彼此吸引，他们二人“热闹而又尴尬”地相识了，成了一对欢喜冤家。其实雪见和景天正是彼此的有缘人，而他们都来历不凡，身藏几世的秘密，随着雪见家族的剧变，二人阴差阳错地步入了江湖的血雨腥风之中，并结识了徐长卿、紫萱和龙葵等人，而等待他们的则是更加惊险的前程和重大的责任。

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仙剑奇侠传3动画化《仙剑奇侠传3》动画概念预告首发，江湖风云即将从此开启。前世今生的纠葛，幕幕情真，情深缘浅。

南诏圣女紫萱与凡人陆临风相爱，陆临风为救她而死。百年后，紫萱化名入青山派，寻找陆临风转世林业平。掌门楚云实为魔族卧底，其女楚湘儿与张玄清因嫉妒屡次陷害二人。紫萱揭露楚云身份，与林业平解开误会定下婚约。楚湘儿施毒蛊令林业平失忆，紫萱带他回南诏疗伤。林业平恢复前世记忆后，二人结婚，产女，然魔尊附身林业平，他为救苍生自毁经脉同归于尽。三百年后，紫萱再遇林业平转世徐长卿，新一世情缘开启。

李逍遥（胡歌 饰）是小渔村的店小二，他意外地与南诏国公主赵灵儿（刘亦菲 饰）结缘并结婚。他们因拜月教徒的追杀而分离，李逍遥忘记了与赵灵儿的过去。后来，他学习了御剑术等法术，并与赵灵儿重逢。在寻找赵灵儿母亲的过程中，他们结识了林月如（安以轩 饰）、刘晋元（王禄江 饰）等人，并经历了许多冒险。最终，他们面对拜月教主（徐锦江 饰）的威胁，赵灵儿牺牲自己消灭了水魔兽，李逍遥等人也各自有了不同的结局。