哈蒙德（理查德·阿滕伯勒 饰）立志要建立一个非同寻常的公园：恐龙将是这个公园的主角。他把众多科学家收归旗下，利用琥珀里面困住的远古蚊子体内的血液，提取出恐龙的基因信息，利用这些信息培育繁殖恐龙。结果如愿以偿，他把怒布拉岛建立成了一个恐龙公园，坚信可以从中赚取大钱。然而，科学家们则忧心忡忡。不幸的事情果然发生了。虽然公园有电脑系统管理，但却因为被员工破坏而造成了无法挽救的失控：所有的恐龙逃出了控制区，人们纷纷逃窜却逃不过恐龙的魔爪。恐龙自相残杀，人们亦死难无数，最后幸存者寥寥，只得四人逃出生天。怒布拉岛上空弥漫着恐怖的气息。

电影的时间设定在恐龙大闹 圣地亚哥事件 四年后（ 第二部的事件四年后）。一名小男孩玩 滑翔翼不幸失踪在索纳岛上。他的父母富商保罗与前妻葛放辨劝阿曼达请求恐龙专家格兰特博士前往搭救。艾伦·格兰特博士（ 山姆·尼尔 饰）无论如何也不愿再返回那个鬼地方。虽然发下重誓，但现状不得不让他收回誓言。他的一项史前动物研究陷入资金紧张的窘境。而这时，富有的商人保罗·科比（ 威廉姆·H·梅西 饰）及其夫人阿曼达（ 蒂娅·里欧妮 饰）找到艾伦，邀请他作为向导带他们乘飞机前往 索纳岛观光。一方面酬劳颇丰，一方面又得知不用着陆小岛，好了伤疤忘了疼轿市巴的艾伦接受了他们的邀请。然而事情却朝相反的方向发展，他们的飞机最终迫降小岛。至此他才得知，原来科比夫妇来此的目的竟是为了寻找失踪的儿子。与此同时他还发现，经过八年的自然进化，恐龙中最聪明的速龙竟然拥有了自己赖以交流的语言。这一次他的探永对手不仅凶恶，而且更为狡猾 。

继索纳岛恐龙逃往事件过去已有八年，艾伦•格兰特博士（山姆•尼尔 Sam Neill 饰）无论如何也不愿再返回那个鬼地方。虽然发下重誓，但现状不得不让他收回誓言。他的一项史前动物研究陷入资金紧张的窘境。而这时，富有的商人保罗•科比（William H. Macy 饰）及其夫人阿曼达（Téa Leoni 饰）找到艾伦，邀请他作为向导带他们乘飞机前往索纳岛观光。一方面酬劳颇丰，一方面又得知不用着陆小岛，好了伤疤忘了疼的艾伦接受了他们的邀请。 　　然而事情却朝相反的方向发展，他们的飞机最终迫降小岛。至此他才得知，原来科比夫妇来此的目的竟是为了寻找失踪的儿子。与此同时他还发现，经过八年的自然进化，恐龙中最聪明的速龙竟然拥有了自己赖以交流的语言。这一次他的对手不仅凶恶，而且更为狡猾……

混沌数学家伊恩·马尔科姆（Ian Malcolm）博士在找到他的日记后，回忆起30年前岛上游乐园的不幸和混乱，那里充满了史前恐龙，它们逃跑并疯狂奔跑......一个故事：6500万块砖块在制作中。 　　After finding his journal, Chaos Mathematician Dr. Ian Malcolm recalls the mishaps and mayhem from 30 years ago about the island amusement park filled with prehistoric dinosaurs who escape and run amok...a story 65 million bricks in the making.

当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时，约翰•哈蒙德曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工场。侏罗纪公园沦陷后，索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇，他重新找到马科姆博士，邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸，他断然拒绝哈蒙德的提议，但当得知女友莎拉已前往小岛之时，只得跟随探险队整装出发。

数十年前，一颗陨石降落在某岛，科考队前来探秘，却遭遇史前霸主暴虐龙袭击全军覆没！之后无数人想解开陨石的秘密，受雇于神秘集团的一队雇佣兵，胁迫女…

三架直升机先后追击闯入了一座被称为“禁区”的无人岛，不料遭遇了翼龙群的攻击而坠毁迫降，九死一生的他们意识到自己闯入了一座恐龙岛，在各种恐龙轮番的攻击下他们不得不结盟并依靠自身携带的武器与恐龙对抗中求生。同时，关于这座恐龙岛更大的秘密也逐渐浮出水面。

黑魔王的元神从封印下逃脱，为了吸取足够的生命能源，黑魔王带领黑魔族小怪，来到地球上恐龙繁荣的侏罗纪，企图通过吸取恐龙身上的生命能源，强大自己的能量，让真身解封，统治宇宙。星猫与12星球战士及时降临，奋力阻止。

李维是基因公司D-TECH的技术工程师，致力于复活史前新物种的研究，一次例会上，李维大胆提出了新的研发思路，获得公司认可，获得阶段性的成功，却意外被公司排除在后续研发计划外。李维偷出公司研发中的迅猛龙蛋，李维多番了解，发现D-TECH已经复制了大量的迅猛龙蛋正在陆续孵化中。原来他们真正的目的是为国外某组织制造恐龙军团。李维与女友和助手决心破坏公司的计划，不料却被主管童明发现……

由野外生存专家吴英雄（李宁饰演）和科研所负责人周芳蕊（王婉中饰演）带领一支装备精良的国际救援队，前往神秘漂流岛—“幽灵岛”营救遇险科考队的故事…