毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了!“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据犯人寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走，却完全找不到破解暗号的方法。另一方面，此时的江户川柯南与灰原和少年侦探团一起，沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时，从兰打来的电话那里，柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实…… 本片为《名侦探柯南》第16部剧场版。

考公三年的沈越，岗位招十人，他考了第十一名。公示期将尽时，他收到一封匿名邮件，附有考公第一名周铭川高中时期校园霸凌的完整证据链。沈越实名举报，招录部门成立专项调查组，层层核查随之启动。面对周父周母四处托关系、学校出具“同学玩闹”的虚假说明、周铭川以十万块收买沈越认假又公开网暴抹黑等重重阻挠，被霸凌十年的许岩、目击同学林知远、拍摄者陈倩野，乃至前女友江疏桐先后说出真相，连许母也承认当年替儿子签下的“和解”并不属实。最终，周铭川被取消拟录用资格，周父因违规请托接受调查；沈越以第十一名身份递补上岸，被霸凌者许岩也终于把憋了十年的话说完。两个人——一个举报者、一个被霸凌者，都在这一场漫长的等待与求证里，走出了各自的阴影，重新开始生活。

考公三年的沈越笔试排名第十一，眼看落榜，却收到匿名邮件，内含第一名周铭川高中校园霸凌完整证据。沈越实名举报，开启专项调查。周家托关系造假、重金收买加网暴抹黑。昔日受害者与证人接连出面作证，揭穿虚假和解。周铭川被取消录用，其父接受调查。沈越递补上岸，受害者许岩吐露十年委屈，二人走出阴霾重启人生。

阳光明媚的一天，东都体育场正进行一场精彩的足球比赛，江户川柯南、灰原哀、阿笠博士以及少年侦探团的伙伴们齐齐到场呐喊助威。城市的另一边，侦探事务所内的名侦探毛利小五郎却接到一通恐怖袭击的电话。这不是游戏或虚张声势，像是在挑衅毛利小五郎一般，路上的汽车在眼前爆炸。阻止犯人犯案的方法只有一个，那就是解读犯人留下的神秘暗号！ 经过一番努力，毛利兰终于拜托工藤新一解开了犯人留下的暗语，成功拯救了无数人的生命。在此之后，警方和毛利小五郎一起锁定了数名嫌疑人，嫌疑人是足球选手、俱乐部老板、媒体人，他们都是和足球界有很深关联的人。与此同时，躲在暗处的犯人继续策划新一轮的袭击，前所未有的大挑战、争分夺秒的对决、裹挟着无数怨恨的袭击强势袭来！

于2021年1月18日至2021年6月24日在洛杉矶小冕剧院的largo夜总会进行录播。

毛利侦探事务所接到了爆炸预告电话。毛利小五郎怀疑这是恶作剧，但紧接着停在事务所前路上的车爆炸了。犯人在留下了神秘暗号并威胁说：“如果找不到炸弹的话，将会有更多的人牺牲。”那个时候，在东都体育场观看J联赛比赛的柯南，因为小兰打来的电话开始针对听到的爆炸预告进行暗号解读。在时间逼近的时候，柯南能平安找到炸弹吗？

毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了！“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据犯人寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走，却完全找不到破解暗号的方法。另一方面，此时的江户川 柯南与灰原和少年侦探团一起，沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时，从兰打来的电话那里，柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实……

第十一季将以“类型化单元剧”为核心创新模式，深度融合影视类型元素与实境探案体验，以“灾难片、刑侦片、西部片、古装片”等多元风格持续突破叙事边界，实现综N代的内容重生与认知颠覆。

本季讲述了女佣之死、校园疑云、第三个女郎、死亡约会四个故事。

主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑暗组织的地下交易后，正准备追踪时却被突袭击昏，并被灌下代号为“APTX4869”的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭着自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、复仇等情节。