传说中世界上有鸟型外星人的存在，因一次飞机意外，多啦A梦、大雄、静香、小夫及胖虎等人进入了鸟人国，并与鸟人古斯基结成好友。鸟人警备队长官滋古连度企图征服人类世界，多啦A梦与大雄一同协助古斯基，救出伊卡洛斯，成功拯救鸟人国及人类世界……

从出木杉那里听了鸟人传说的故事的大雄靠自己的力量反复做飞到天上的实验然后撞到了突然出现的人力飞机。 撞到的是一个长着翅膀的鸟人古斯基，他们把古斯基藏在鸟箱型露营胶囊里，修理着古斯基坐来的人力飞机的哆啦A梦他们坐着那个飞机飞了起来，天空中突然出现一个巨大的洞把大家都吸了进去！！ 大洞的另一侧是住着鹳身的接生婆，塘鹅邮递员的鸟托邦，哆啦A梦他们戴着小鸟帽成了鸟人的伙伴。 古斯基在候鸟巡逻队的入队测验的伊卡洛斯耐力赛中优胜，但不是用自己的翅膀，而是人力飞机，于是被取消了资格。 为了寻找受到冲击而失踪的古斯基哆啦A梦他们去了猫头鹰博士那里，猫头鹰博士却被乌鸦警备队的滋古连度带走了！ 被人类袭击过的滋古连度谋划着在拉拉亚多山的龙之谷里寻找拥有强大力量的怪兽菲尼基亚。 哆啦A梦他们和传说中的鸟人伊卡洛斯一起去了拉拉亚多山…。 最终哆啦A梦他们能否拯救鸟托邦？

因为玩具机器人，大雄（小原乃梨子 配音）受到小夫（肝付兼太 配音）和胖虎（立壁和也 配音）的奚落，连哆啦A梦（大山のぶ代 配音）不愿帮他。为了寻找生气走掉的哆啦A梦，大雄通过任意门来到寒冷的北极，却在这里发现奇怪的机器人零件。在此之后，各式的零件源源不断从空中掉落至大雄的家中。由于零件过于巨大，为了不引起骚动，两个好友将机器运到镜面世界，并组装成巨大的机器人。他们兴奋地邀请静香（野村道子 配音）来镜面世界玩耍，偶然间发现机器人竟然装备有威力强大的武器。不久，一个名为莉露露（山本百合子 配音）的女孩出现在小镇上，她自称是机器人的主人。大雄他们热心地将镜面世界工具借给莉露露，却发现她在那里建立了毁灭地球的基地……

小風在偶然的机会下认识了大雄，并被大雄收留成为好朋友。大雄、哆啦A梦和带小風无意间闯进了风之村，这里的人都是利用风从事所有的事情。此时，被封印已久善于利用风做坏事的岚族邪恶族长乌兰达被唤醒过来，竟然想重新利用怪物馬風卡征服世界，可爱的小風竟然是怪物馬風卡的一部分，为了拯救世界及小風，大雄及哆啦A梦将要一起经历一个不可思议的旅程。

炎炎夏日，为了找到所向披靡的独角仙，大雄（大原めぐみ 配音）痛哭流涕，对哆拉A梦（水田わさび 配音）软磨硬泡。无奈之下，哆拉A梦和哆拉美（千秋 配音…

又到了春假，大雄约定与爸爸去白金酒店。大雄本来非常高兴，但是却不知道酒店的实际位置。而一个神秘手提箱送到了大雄的家里，大雄通过这个手提箱来到了白金酒店。本来大雄与哆啦A梦在岛上愉快的玩耍，但是哆啦A梦却突然失踪了，原来哆啦A梦被神秘的火箭载走了。之后大雄遇到了沙比欧，原来沙比欧是来自查魔查星的宇宙人，而哆啦A梦被机器人军队带走并弄坏了。为了拯救哆啦A梦，大雄决定去查魔查星，向独裁者那波吉斯特勒一世挑战。

大雄在睡梦中通过粉红色的雾走进一个动物王国，里面人人和平相处，科技发达，是真正的乌托邦！原来动物王国是在遥远的星球，而粉红色之雾是来自未来世界的随意气，是可以用来通往遥远的地方！哆啦A梦回到地球后，收到未来动物星球的求救消息，但随意气已经用完，他们该怎么办呢？ 　在这个绿色的动物星球上，都是些爱好和平的动物们。但和动物星的平行星中，却住着贪婪的人类。于是战争又开始了……

在北极，大雄拾获巨大机械人之脚与神秘的蓝色球体。受到这蓝色球体的引导，一件一件的机械人零件降落在大雄家的后园。多啦A梦与大雄在镜面世界里把机械人零件组合，结果完成了巨大机械人--圣诞武士。后来那蓝色球体成为圣诞武士的脑袋，并发放出信息。多啦A梦用对话盒把它变成雏鸟的型态，令它变成可以与人对话名为皮波的东西。一天，一位声称是机械人的主人，名叫莉露露的不可思议女子出现。为了侵略地球，机械人星球美卡托比亚送出圣诞武士及莉露露，目的是要在地球建立基地……

因为相信云上有天国存在的大雄，去图书馆找资料（全都是神话故事），后来想离家出走，去找天国，目前要令哆啦A梦担心他，后来哆啦A梦和大雄在云上建造一个自己理想中的国家，并且在朋友们的协助下完成了王国。但是，某天在气流的影响下，撞到高山，发现了一个男孩（塔卡洛）在一只有耳的巨型乌龟（后来得知是绝迹的雕齿兽）的背上，最后却意外发现真的有天上人居住的天上世界。天上世界的保护区保有了许多地上的已绝种动物。天上人因为担心地上世界的人类再继续这样污染环境，地球迟早会灭亡，所以计划实施“把地上世界的动植物和人类送到天上世界避难，再以大洪水将地上文明全部毁灭”的恐怖策略──“诺亚计划”……。

骨川小夫拿出现在畅销的神秘火车的车票炫耀。刚田武，源静香也想乘火车，恳求小夫也带他去。这时，大雄跑来，说哆啦A梦3天也没有回家。小夫和胖虎之后也去了找哆啦A梦，大雄只顾找哆啦A梦，连晚餐也不吃。哆啦A梦回来后，说他到了22世纪买银河列车的车票。哆啦A梦他们乘搭银河列车到银河各个星群游览，另一边，神秘的生命体正悄悄来袭……