1992年，日政府在关西的筑波建立国际哥斯拉对策中心。世界科技精英共聚一堂，合力研究一部G超武器—机械哥斯拉。以大前博士为首的考察团到达亚度诺亚岛时，发现了一只完整无缺的蛋。当团员把蛋带回京都时飞翼龙拿顿出现并攻击考察团一行人。这时哥斯拉亦在亚度诺亚岛出现，两只怪兽由海上战斗到陆上……

一道亮光划过天际，太平洋上波涛汹涌，海浪以不可思议的速度将一架货机卷入海里；巴哈马丛林中，出现了巨大的脚印；一股神秘的力量一直朝纽约而来，这座人口稠密的都市即将受到这个怪兽“哥斯拉”的袭击。“哥斯拉”是因为核试验造成气候异常而发生变化的恐龙，这只高90英尺庞大怪物的复活使整个纽约陷入一片混乱。科学家、新闻记者、电视台摄影师、军人等都联合起来对付它，但它造成的恐慌和破坏实在太大，以至所到之处全部化成废墟。

1999年，某个东西被卡车运出了馆山市。几天后，哥斯拉登陆了馆山，特生自卫队出动与之展开了苦战。在战斗中，自卫队员家城茜（釈由美子 饰）意外害死了战友叶山二尉（森末慎二 饰），自己却侥幸活了下来，并被派去了资料科。 另一方面，日本政府在柘植真智子首相（水野久美 饰）的指挥下，召集了汤原德光（宅麻伸 饰）等科学家开始研究对付哥斯拉的G兵器。他们以在馆山冲挖掘出来的初代哥斯拉骨骼为基础，用了四年制成了机械哥斯拉——3式机龙。柘植首相辞职，由科学技术厅长官五十岚隼人（中尾彬 饰）就任新首相。同时，茜被派去了机龙队，担任机龙的操作员。 就在准备机龙测试机动时，哥斯拉又在东京湾出现了。机龙赶赴现场与哥斯拉对战，却因哥斯拉的吼声唤醒了体内的野兽灵魂，突然暴走，在城市中造成了大破坏。 为了改良机龙，汤原改变了机龙DNA计算机的碱构造，使机龙不会再受哥斯拉叫声的干扰。但由于对再次暴走的担忧，五十岚迟迟不允许出动机龙。 哥斯拉再度出现在东京湾，一路无视特生自卫队的攻击来到了品川，令城市变成了一片火海。面对如此情景，五十岚终于同意让机龙出动。 为了打败哥斯拉，机龙被送到了品川。茜也抱着必死的觉悟。机龙和茜的战斗就这样开始了。

据日本共同社12月8日透露，人气怪兽系列电影《哥斯拉》新作将投入拍摄，计划2016年上映。这是继2004年《哥斯拉 最后决战》上映以来，再次出品日版哥…

二战结束后不久，日本南海惊现离奇事件，打捞船荣子丸在平静的海面上突然遇难，幸存者寥寥，前去搜救的宾果丸也一去不返。不久，南海附近的岛屿大户岛遭…

《酷斯拉》上映后，许多欧美影迷给了它一个绰号：GINO，意思是“GodzillaInNameOnly”。延续电影的剧情，美日的两家公司共同制作了《哥斯拉：动画系列》，总共两季，亚洲区HBO曾在2000年播出过中文字幕版。在此系列中，尼克·塔特普洛斯意外发现了那颗没有被摧毁的蛋，刚好此时蛋孵化了，刚出生的哥斯拉因为对尼克不小心沾到哥斯拉蛋的羊水产生了铭印而亲近他，后来更和主角们一起帮人类对抗接踵而来的其他变种怪兽。动画版的哥斯拉和电影版的不太一样，因为要面对多种不一样的怪物，就要拥有强大的力量，制作公司刻意使动画版的哥斯拉近似原版的哥斯拉，所以让它也可以吐出强力的热线，拥有日版一般坚硬的皮肤，导弹之类的武器已经无法伤他分毫。动画的剧情走向很好，对人类内心的黑暗也进行了刻画。比起索尼电影版《酷斯拉》更受原著迷的认同。

二十世纪最后的夏天。那一天人类第一次知晓，自己并非地球唯一的支配者。　　　地球上出现了巨大生物“怪兽”和能够驱逐怪兽的强大的存在——“哥斯拉…

哥斯拉将在本片中与魔斯拉、拉顿和它的死对头——三头王者基多拉展开激烈对抗，而人类除了作为观众以外，能否有拯救自己星球的机会呢？人类的命运岌岌可…

2009年，动物基因组学 （帝王计划）研究机构的一个小组在一座庙里研究着魔斯拉。她从幼体中孵出，在一群雇佣兵袭击这个机构时，魔斯拉逃了出去。然后她在一个瀑布包了茧，随后破茧而出，完成了全形态生长。2014年，哥斯拉被整个世界看到后，“帝王组织”在水下建了一个基地，在这个位于水下好几英里的水中基地中，他们研究着哥斯拉和其它可能存在的生物。那是他们真正的研究核心。在“旧金山事件”结束后，人类获得了短暂的和平。但这并没有阻止怪兽们觉醒，反而更加来势汹汹，长期沉睡于地底和冰川里面神秘的巨兽在星球上面已经有上万，甚至好几万年的历史，它们要把这个星球重新夺回自己的手下。接连出现在人类眼前的怪兽纷纷证明了一件事：它们才是地球的真正霸主，不论是地球的守护者还是毁灭者，战至最后的一位才能成为怪兽之王，“统领”全世界。正当帝王组织也一筹莫展之际，哥斯拉突然苏醒，它去消灭那些未来可能会去损害大自然平衡的生物。后来，哥斯拉和魔斯拉、拉顿以及它的强敌基多拉相遇。而击败基多拉正是抑制这次怪兽袭击的关键，两位王者巨兽的正面对决就此打响，在城市中一分高下，证明谁才是真正的怪兽之王。面对怪兽争霸，人类也没有选择袖手旁观，而是英勇无畏地冲向这些庞然大物，与哥斯拉并肩作战，誓死为地球存亡而战 。