封神战后三界失衡，阐教势弱，天庭主宰昊天为一统三界，暗中布局，借东海龙族之手，以陈塘关全城性命相胁，逼死灵珠转世的哪吒。其师太乙真人护徒成狂，震怒之下血洗四海，以九品圣莲重塑哪吒肉身，助灵珠之力完全觉醒。正当尘埃落定，二人欲归山之时，元始天尊急诏传来，昆仑陷入危局，更大的风暴才刚刚拉开序幕。

哪吒剔骨削肉、含恨自刎，徒留满腔冤屈。其师太乙真人护徒成狂，震怒之下血洗四海，以九品圣莲重塑哪吒肉身，助灵珠之力完全觉醒。复活后的哪吒褪去稚态，少年桀骜中藏着淬骨之痛与深沉锋芒，与师父一路横扫仇敌、撕破天庭伪善面具。从陈塘关血战到杀上天庭，师徒二人直面龙族始祖、天庭圣威与师门叛贼，以逆天之势破局。哪吒借圣威、展三头八臂，怒惩昊天，洗刷冤屈。

商朝末年，灵珠子降世陈塘关总兵李靖府中，是为哪吒。哪吒幼时因杀死敖丙，被敖广逼迫自杀，哪吒削骨还父削肉还母，其元神幸得被太乙真人所救，获得重生。重生后，哪吒失去记忆。敖广趁机用虚假记忆利用哪吒，哪吒被卷入灭世阴谋。 在不周山下，面对着亦真亦假的记忆以及与自己对峙的父亲，哪吒将作出何种选择？李靖以自己的生命能否唤醒哪吒？灭世阴谋的背后又隐藏着怎样的秘密？

商纣王被狐妖妲己迷惑双眼，导致妖孽盛行民不聊生，元始天尊遂炼化混灵珠助周伐纣。座下弟子太乙真人辅助混灵珠投胎于李府，转世为人，取名为哪吒。 哪吒十七岁这年因目睹李靖捉妖而愤然与父亲决裂，母亲殷夫人意外死在妖孽手上令他万念俱灰。哪吒为救下陈塘关百姓牺牲了自己。然而邪恶的申公豹令哪吒重生为魔，六亲不认，在其指使下残害陈塘关百姓。 祭天之夜，三界大门打开，妲己用李靖和孩童祭天，与父亲对战的哪吒最终才知道，父亲为复活自己，用爱封印了自己的生命，保护哪吒留存前世记忆，肉身不灭。哪吒被感化幡然醒悟，申公豹抵抗不了正义与爱的力量，最终败在哪吒的手下。

陈塘关天降灵珠，哪吒降生却被视为妖童。他天生神力、嫉恶如仇，因大闹东海、打死敖丙，引来龙王水淹陈塘。为救全城百姓，哪吒削骨还父、割肉还母，以死谢罪。太乙真人以莲花为他重塑肉身，哪吒逆天重生，神力大增。面对龙族再犯、苍生危难，他放下恩怨，守护百姓，最终战败龙王，平息海祸。从叛逆少年到苍生守护神，哪吒用一腔热血，打破宿命，喊出“我命由我不由天”的逆天传奇。

封神后哪吒发现陈塘关后人李炎与母张春梅遭恶霸欺压，违抗天规下界相助。李炎被白月光胡莉诱骗，遭张莽、王爆夺走族长令牌放血献祭。哪吒以意识附身濒死的李炎，助其修成三昧真火。李炎在鬼市斗宝获横财，拍卖会上得杨戬后人杨妙妙相助铲除恶霸，却遭胡莉窃走关键龙筋。李母遇害引发误会，苏婠以神力现魂证清白。敖总设局致李炎身亡，哪吒助其莲藕真身复活。

封神后哪吒发现陈塘关后人李炎与母张春梅遭恶霸欺压，违抗天规下界相助。李炎遭张莽、王爆夺走族长令牌放血献祭。哪吒以意识附身濒死的李炎，助其修成三昧真火。李炎在拍卖会上得杨妙妙相助铲除恶霸却遭胡莉窃走龙筋。敖总设局致李炎身亡，哪吒助其真身复活。

龙王携四海龙王以水淹陈塘关逼李靖交出哪吒，哪吒自刎肉身消亡，太乙欲建庙助他重生。 燃灯道人赠李靖玲珑宝塔，说哪吒无功受香火会受魔心反噬。李靖不忍让哪吒入歧途决定毁庙引哪吒误会，而李母与太乙偷偷供奉哪吒牌位。龙王在哪吒复生之时突袭，众人都被压在塔下。误会颇深的父子腹背受敌，一边要与对方打斗，一边又要提防龙族和塔内怪兽的袭击，于是决定先放下芥蒂逃出凶险之地。 二人进入宝塔深处，幻境纷至沓来，敌人潜伏其中，随时袭击疲于奔命的父子俩。 两人同行，最终冰释前嫌，共同击败龙王。

该片讲述了哪吒将作恶多端的龙王三太子斩杀却被父母及世人误会选择自杀，在太乙真人的帮助下哪吒与龙王三太子双双死而复生，重生后的两人再次相遇的故事。

三千年前，哪吒斩敖丙遭到龙族讨伐，为保护陈塘关百姓自爆身亡，龙族为了泄愤，将哪吒魂魄囚禁于神龙殿，并为李氏后人种下诅咒，李氏后人剥夺命格，活不过天命之年，三千年后，李氏有女李云霄，再一次踏上了神龙殿！