龙剑飞被“无定飞环”孙碧玲打伤，囚禁于“再世牢”。裘玉华、裘玉娟姊妹救他，他在玉华房中养伤。为吊开人注意，玉娟穿上“火云战衣”逃走，被打下山崖。裘玉华与龙剑飞私奔，祖母“无定飞环”阻截，要下毒手。六十年前的江湖恩怨如何化解？

武林之中，“如来神掌”和“天蚕神功”被称为传奇，失传已久。一晃眼三百年过去，“如来神掌”重出江湖掀起了一场腥风血雨，人人都知道，只要夺得了如来神掌的秘籍，即是获得了掌控武林的金钥匙。 段飞（张智霖 饰）出身贫寒，又因为见义勇为而被人捉住了把柄失去了赖以生存的工作和住所，无奈之下，他只得投靠与自己有过一面之缘的老人火云邪神（孙兴 饰），却不知这位看似平凡的老人竟然就是江湖上人人得而诛之的魔头。一次偶然中，段飞邂逅了孤苦伶仃的屠雪华（朱茵 饰），两人渐渐坠入情网。某日，天蚕神功惊现江湖，而无辜的段飞再一次因此而背负上了不白之冤。

如来天尊（曹达华）自创九式“如来神掌”，武功盖世，引起群雄争夺，天尊受扰圆寂，临终前把毕生武学传给徒弟古汉魂（万梓良），并赠“火云战衣”。古自号“火云邪神”，滥杀无辜，引起一场武林浩劫。廿年后，一个叫龙剑飞（尔冬升）的青年，未被师父赏识，又反对他与其女儿（余安安）相恋而被击下山崖，幸好得邪神救回，收其为义子，再授他如来神掌，转赠“火云战衣”……

一代武神叶炎受问心门谷主左雍点化，放下屠刀，参悟以武修禅。修炼《如来神掌》，换来痴傻三年。三年期满，浩气盟觊觎神功，率众进犯问心门强夺秘籍。门派陷入生死危机，叶炎骤然灵台清醒挺身而出，救下众人，劝诫浩气盟摒弃私欲，恪守侠者为国为民的本心。

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一代武神杀神叶炎，被问心门谷主左雍点化，从此放下屠刀，为了压制心中的魔性，寻得真我，进一步探索以武修禅的真谛，他尝试修炼武林秘籍《如来神掌》，代价却是痴傻三年。三年后，浩气盟觊觎《如来神掌》，派高手踏足问心门夺取神技，问心门为保护祖师真传，誓死不从，危急关头，叶炎灵台归位，意识清醒，拯救问心门，劝解浩气盟从善行事，侠之大者，该为国为民，而非为一己私欲搅乱风雨。

大魔头“铁面修罗”六十年前被“火云邪神”打断右腿，如今要练成“天残脚”来称霸武林。通过徒弟小龙女，“铁面修罗”在江湖行恶，但小龙女日渐长大，渐有恻隐之心。最后，在龙剑飞与“铁面修罗”决斗中，小龙女以宝剑刺进“天残脚"”死穴，亲手除去自己邪派的师父.

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《如来神掌》第一部上集：龙剑飞资质不高，学武不成，面部又被师妹毁容，更受到其夫婿欧阳豪的侮辱及谋害。后被“金眼神鵰”救回火云洞，拜“火云邪神” 古汉魂为义父，先后学得“如来神掌”和“七旋斩”。古汉魂六十年前曾被无定飞环孙碧玲暗算，两人失明。龙剑飞去取金龙之子为古汉魂治双目，孙碧玲的孙女裘玉华和玉娟也来了。龙剑飞救了两人，并给她们一对龙子，自己也恢复了容貌。又得长离教主毕孤授他七旋斩。古汉魂复明，让龙剑飞送回龙子。龙剑飞再遇裘玉华和玉媚，一起救出脱离魔教的陆瑜。孙碧玲见到龙剑飞穿着火云战衣，将他打伤，生死未卜。

影片描写广告公司职员刘德华与陈百祥，在前往大陆公干时无意中发现一个秘洞，取得元朝秘笈，解救了冷封多年的元朝公主王祖贤和梅小惠，同时也释放了邪派高手元华。刘与陈带了王与梅回香港，本以为她们不能适应现代生活，不料公主聪明过人，竟精通多国语言，并教刘学成秘笈中的如来神掌。此时，暗恋公主的元华追到刘家，与刘展开了一连串的生死斗。