工藤新一是全国闻名的高中侦探，他在追捕黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现。在被打昏后，被喂食了神奇的药水，工藤新一又变回了小孩的模样！新一找到了经常帮助自己的阿笠医生，医生为他量身定制了不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对自己进行报复，新一决定隐藏身份，暗中追踪他们，希望能够得到解药。一天，新一的女友毛利兰来到阿笠医生家寻找男友的下落。被小兰抓住的新一在情急之下化名为江户川柯南，随后柯南就住在了小兰家里。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探。新一通过与夜行人合作破案，可以追查到他的下落。柯南在小学时结识了步美等小学生，他们一起组织了青春侦探团，向犯罪分子宣战！

阳光明媚的日子，江户川柯南（高山南 配音）、毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和可奈 配音）等人抵达京都。他们即将登上自卫队的宙斯盾舰，体验海战的刺激。途中，他们邂逅了美丽而又略带神秘感的女自卫队队员藤井七海（柴崎由希 配音）。然而，欢乐的气氛很快被恐慌所笼罩。战舰上突然发现了一条断臂，自卫队队员的失踪在军方引发了恐慌和猜测。原来，来自某国的神秘间谍X已经悄悄登上宙斯盾舰，准备窃取舰上的绝密情报。 为了查出隐藏的敌人，柯南联手灰原爱（林原惠 配音）、阿笠博士（绪方健一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）、远山一叶（宫村优子 配音），与间谍展开一系列斗智斗勇……

柯南、小五郎一行人来到太平洋上美丽的神岛度假。这座岛屿历史悠久，令人联想起一处名为“海中宫殿”的沉没古代遗迹，以及300年前两位女海盗留下的宝藏传说。小兰和园子不畏流言蜚语，潜入“海中宫殿”附近时，偶然发现了一大群寻宝者。突然，其中一人被鲨鱼袭击身亡！小兰和园子逃脱了，但目睹了寻宝者离奇死亡的柯南，加入了灰原的调查。 柯南认为寻宝者的死与宝藏传说息息相关，努力解开谜团。“海中宫殿”的谜团始终萦绕在他的脑海中。他发现了一个名为“海盗旗”的神秘标志，正期待着破案，寻宝者却突然出现，偷走了宝藏！小兰和园子落入猎人之手，生死未卜！传说中隐藏着什么信息？“海底宫殿”又隐藏着什么秘密？柯南誓要逐步解开跨越300年时间的密码之谜。

世界体育盛会——世界体育用品运动会（WSG）即将在日本东京拉开帷幕。一辆时速高达1000公里的真空超导磁悬浮列车即将亮相。在WSG赞助商的欢送仪式上，主办方宣布，除了赞助商和嘉宾外，还将通过抽签的方式选出列车的首批乘客。少年侦探团的成员们得知消息后，跃跃欲试，却未料意外发生。欢送仪式上，数名高级官员被绑架。 在这关键时刻，柯南和赤井秀一与事件背后的真凶展开了一场与时间的赛跑……

新井贵宏的《名侦探柯南》官方衍生剧《名侦探柯南：零的日常生活》由原作者青山刚昌监修。 这位三面人不仅是一名公安警察，还是一名私家侦探和暗黑组织的间谍。他的私生活一直是个谜，但或许已经无法掩盖。穿梭于黑暗与光明之间的安室透，即将揭晓他的日常模样！ 《名侦探柯南：零的日常生活》将于2022年上线，Netflix独家播出。

有一天，毛利小五郎收到一份邀请，这是来自一个神秘人的请求，需要去横滨的一个游乐园玩。小五郎和柯南开开心心的来到游乐园，还戴着可以让他们毫无阻碍地进出游乐园的手表，代表着VIP身份。不料却落入了神秘人的圈套，所有戴着手表的人都不得离开游乐园，否则就会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，如果柯南和小五郎不能解开谜团的话，小兰和少年侦探队也会连同游乐园一起土崩瓦解。然而更让人想不到的是，这个男人居然直接叫柯南叫工藤新一。

堂本和树是著名的钢琴家，两年前他突然宣布不再弹钢琴转而弹管风琴，并斥资修建堂本音乐厅，计划在落成当天举办音乐会。然而音乐会前，堂本音乐学院的学生相继身亡，先是爆炸，然后是单杀。 园子带着柯南一行人去听排练，并结识了女高音歌手秋叶玲子。拥有绝对音高的秋叶也开始遭遇危险：润生茶被下药，在森林浴时遭到气枪袭击，试镜当天被打昏。 然而，正是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图将秋叶排除在谋杀之外。已经正式开始的音乐会，却浑然不知音乐厅外发生了爆炸。小兰、灰原爱和音乐厅的千余人陷入危险，绝对音高成为唯一救命的线索，柯南发现了爆炸的逻辑，必须在引爆最后一枚炸弹之前找到犯人。

漆黑的夜晚，一名间谍悄悄潜入日本一家警察局，窃取了包含国际情报机构重要数据的绝密文件。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）立即展开追捕。最终，逃犯的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）等人前往东斗水族馆，发现一名受伤的美人（天海由希 配音）。女子患有失忆症，手机也坏了，无法使用。柯南等人承诺帮助她恢复记忆。就在他们讨论此事时，黑衣组织成员维尔茅斯（小山美美 配音）在暗处冷冷地观察着。在两人的互动中，女子非凡的技能和怪异的举止让灰原哀（林原惠 配音）开始质疑她的真实身份。 原本平静欢乐的水族馆，却没想到，神秘女子恢复的能力，却很快将他们卷入黑衣组织的血腥混乱之中……

故事发生在东京八丈岛附近海域，连接全球警察监控系统的高科技设施“太平洋浮标”即将投入使用。来自世界各地的工程师齐聚一堂，共同连接欧洲刑警组织的管辖范围。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中…… 与此同时，柯南一行人正在前往八丈岛观鲸。途中，柯南接到冲矢昴（赤井秀一饰）的电话，告知他一名欧洲刑警组织成员在德国被银谋杀。柯南决心调查此事，潜入了“太平洋浮标”。就在工程师们为系统启动做准备之际，突如其来的变故发生了！一名女工程师被黑暗组织绑架，载有她关键技术的U盘也落入了他们的手中！ 就在这时，水下传来潜艇接近的诡异声响，一个神秘的身影正向灰原哀逼近……

知名舞台剧演员真木梨在这一天收到了来自怪盗基德的警告信：在四处飞散的26封信中，他来领取价值连城的“命运之石”。毛利小五郎受真木梨委托分析信件，认为基德会在公演的最后一晚来偷走宝石。当晚，他和柯南、小兰等人来到剧场，剧场里已经等候着许多警察。 令柯南惊讶的是，基德伪装成工藤新一出现在众人面前，但在他和众人紧张地分头行动后，宝石并没有被偷走。柯南意识到这封警告信和航班有关。柯南、小兰、真木梨和同事们乘坐的飞往北海道的飞机上，还有另一起谋杀计划正在被精心策划。