为了消除所有可能的民族主义分子，清皇帝下令摧毁少林寺——被认为是反满洲抵抗运动的焦点。寺庙被烧毁，幸存的106名少林弟子发誓要闯入皇宫，向暴君报仇雪恨。

二十年前，通天教主应天生因作恶多端被各大门派掌门围攻至死但元神不散，少林方丈将其收入宝盒放入少林寺塔顶。二十年后，少林弟子无花打扫塔顶被元神附身后下落不明，十年后，无花长大成人重出江湖发誓报三十年前之仇，先后杀死少林方丈与天山二老。江湖一片恐慌，均怀疑是应天生之弟马王庄庄主应天寿所为，吉天祥为调查真相夜闯马王庄，被应天寿之女应彩凤所救，应彩凤对吉天祥一见钟情。吉天祥离开后，应彩凤担心天祥安危离开马王庄四处寻找……

本片录像带名为《翻子地躺功》，为中韩合拍片，早期韩式武打喜剧片，讲述王爷女儿被强盗绑架，要挟王爷交钱赎人，王爷请高手相救，最后是打败了强盗，营救出了千金。

南北朝时期，连年战乱。一悟道高人，姓姬，名神光，看破红尘，欲皈依佛门，来到少林，要求达摩方丈为之剃度出家。姬神光在雪中侍立三天三夜，达摩方丈不愿收留，于是说，要我收你为徒，除非天降红雪。姬神光出家决心已定，乃自断左臂，天遂降红雪。达摩为他的诚心所感，遂收为弟子，赐法名慧可。 十五年后，达摩已圆寂，慧可成为少林寺第二代方丈。手下有五个得意弟子，依序为：惠橼、惠石、惠努、惠忍、惠空。都习练武功，各怀绝技。 慧可方丈潜心清修，禅悟精深，成了当朝太后的经师，经常进宫为太后讲经说法。洛阳王高奇是方丈的故旧相识，来找慧可方丈下棋。慧可说起，近来尘事纷扰，弟子们都难以静心清修。洛阳王说，朝廷在扩充后宫，让各地征召民女送进宫中，催逼得很急，圣命难违。按前朝规制，后宫已经过于浩繁，但如今废立频繁，战乱又多，谁得了天下不想及时行乐?

隋朝末年，天下大乱。各路诸侯自立为王，烽烟不断百姓遭殃。为了保寺济民，昙宗创立了“罗汉奇门棍阵”，此阵由“八卦”、“五行”组成，必须齐聚十三人。于是，昙宗边躲避王世充追杀，边寻觅可造之材，历尽艰险，收录农民周锦福、官宦子弟张天保、落魄大少高飞扬、江湖艺人佟锐、当朝国师桓法嗣、嗜武如狂的“姚汉武”、憨直的九斤、改邪归正的“王仁义”，以及少林寺的“僧丰”、“僧满”、“道广”、“智守”和昙宗本人组成了棍阵。

明末，农民起义风起云涌，关外满族又蠢蠢欲动，世间生灵涂炭，明朝守将关志远被叛徒出卖，敌人里应外合，边关失守，致使全军覆没。危难之际，关志远唯一的儿子关少龙被少林寺的高僧救起。关少龙身负国仇家恨，在少林寺苦练武功，十年之后，当他学成期满时，按照少林寺的规矩，只有经过少林寺十八铜人巷的考验才可以下山。经过艰苦奋战，少龙终于如愿以偿。而这时他也知道父亲当年是被一奸细出卖，而这奸细如今已经是高官而且武功奇高，凭借勇气和不服输的劲头，经过一场血战，终于手刃仇人，报了血海深仇。

康熙年间，康熙与少林方丈密谈之后，少林寺派出七个和尚护送三个官员和一个神秘宝盒至西域，关于宝盒的一切，无人知晓，正因如此，引来朝廷内部以及江湖各派的注意，太子党怕此宝盒会影响太子登基一事，于是派人暗中作梗。前明余党对此宝盒也是加倍关注，为弄清宝盒之谜，派人明抢暗盗。少林寺弟子一路西行，千辛万苦，遭遇种种危机。

隋朝末年，隋将王世充的侄子王仁则（于承惠 饰）在督建河防工事时，杀死了起来反抗暴虐的神腿张，但令其儿子小虎子跳河逃离虎口。小虎子被少林僧人救起收入寺中后，为报父仇毅然削发为僧，法名“觉远”（李连杰 饰）。 王仁则的侍卫长遇见牧羊女白无瑕（丁岚 饰）后垂涎其美色，强行将其抢回府并欲酒后施暴，恰巧被只身前来报仇的觉远发现。在救白无瑕逃生的过程中，觉远因武功欠佳被王仁则刺伤，促使其回到少林寺后更加刻苦练功。后因觉远救援被王仁则追赶的李世民，少林寺遭遇劫难，觉远身上的责任更重一层。

少林寺方丈深知该寺迟早必有大劫，决定广收俗家弟子，以栽培及造成野草蔓地除之不尽之势。当时前往少林寺习武者有方世玉、胡惠乾、洪熙官等等。方世玉与胡德帝之父皆为人所殺，他们前來少林习武目的就是为父报仇。方与胡武艺学成，决定从木人巷闯出寺去。方与胡报仇后，发觉清兵已对少林寺展开偷袭行动，于是前往少林护寺……