清军主力入关后，大清王朝定都北京。经过明末清初的战火摧残，华夏大地急需太平安宁。但就在顺治十八年，恶疾天花袭击皇宫，皇帝爱妃命丧黄泉，顺治皇帝痛不欲生，决意遁入空门。危急之际，孝庄太后力挽狂澜，下令改朱批，行蓝批，同时立下诏书：清顺治十八年正月初七，顺治皇帝龙御归天。公元1661年，在孝庄太后的扶植下，天花大病初愈、年仅八岁的爱新觉罗·玄烨登上了大清皇帝的龙座，称康熙皇帝。翌年改元康熙。

清顺治十八年，恶疾天花袭击皇宫，皇帝爱妃命丧黄泉，顺治 （刘钧 饰）痛不欲生，立意遁入空门。危急之际，孝庄太后 （斯琴高娃 饰）力挽狂澜，下令改朱批，行蓝批，并将天花大病初愈年仅八岁的玄烨 （陈韦辰 饰）推上龙座，成为康熙皇帝。康熙 （陈道明 饰）即位以后，鳌拜 （姚长安 饰）等权臣威迫有加，连孝庄太后也只好含辱。鳌拜亲政，开始，康熙改归皇权，权臣竟图谋废君改朝，康熙被逼殊死相争，最终智擒鳌拜，肃清政敌。吴三桂 （曹永祥 饰）等三潘拥兵自重，独霸一方，康熙年轻气盛，下旨撤潘，引发三潘之乱，朝廷兵将屡被吴三桂击败，明皇后裔朱三太子 （卢勇 饰）也乘机举起反清复明的大旗。太监造反，宫延大乱，康熙陷入绝境，意欲退位，在孝庄太后的怒斥与激励下，康熙重振精神，起用汉臣周培公 （李明 饰），与吴三桂拼死一搏，得到了最后的胜利。中国康熙时代，已经是国富民强，一片盛世景象。郑成功后裔郑经 （刘大印 饰）割台湾岛自立，不肯归降，蒙古葛尔丹也磨刀霍霍，推崇元大都立誓杀回北京，康熙为安扶葛尔丹将爱女嫁葛尔丹，暂缓西北局势，然后起用明将施琅一举收复台湾，继而掉转枪头率二十万大军，在辽阔的草原上进行了殊死的决战，全面消了葛尔丹的余部，完成了中华民族版图的统一。凯旋班师以后，孝庄太后归天，太子与权臣结成同党，意欲提前即门，康熙废除太子，引发夺嫡之争。千叟宴上，康熙即将宣布立储遗旨，却猝死在龙座上，诏书随风飘落玉阶，无人知晓它的神秘。