该剧改编自清闲丫头所著同名小说。故事延续第一部的剧情，讲述三法司少年团联手“攘外”，将一个个看似毫无关联的案件抽丝剥茧、扎根串联，护百姓安宁，更守家国平安的故事。

唐中晚期，来自西南山区仵作世家的少女楚楚，为实现当仵作的梦想独自来长安闯荡，参加仵作考试，遇到断案如神的安郡王萧瑾瑜。萧瑾瑜招收楚楚作为仵作搭…

讲述了俞逸夫饰演的太子殿下莫临川，因为逃婚躲进衣柜直接穿越到了现代，并创业成功成为总裁。华德西饰演的苏饭饭原是太子的带刀侍卫，一直在追寻失踪的…

民国时期，一名默默无闻的仵作宋寻意外获得《洗冤录》书灵附身，摇身一变成为破案奇才。他凭借超凡的验尸技巧，不仅救活了大帅之女苏夜寒，更屡破奇案。面对重重阻碍，宋寻运用独特的验尸方法，如银针救治、伞验法等，一次次揭开真相。然而，随着调查深入，他发现这些案件可能与自己哥哥的死亡有关。在破案与寻找真相的道路上，宋寻将如何应对重重挑战，揭开隐藏在案件背后的惊天秘密？

法医学女学生江篱意外进入仵作试炼游戏世界，只有帮助游戏NPC仵作沈修宁一同破案才能回到现实世界。江篱靠着现代科学手法屡破奇案，也发现自己已经深深爱上了沈修宁，但两人却不得不面临着分离……

千金小姐君青蓝惨遭家族抄家灭门，昔日未婚夫李从尧非但未施以援手，还亲手毁掉她的容貌。她死里逃生，改头换面，女扮男装化身大理寺仵作，隐忍蛰伏一心翻案复仇。却不想与李从尧再相遇，昔日挚爱已然变成冷血狠戾的端王，还强行将她掳来肆意囚禁。爱恨纠缠，权谋诡谲接踵而至，旧案疑云层层浮现，一场复仇与情愫之间的博弈再次展开。

现代法医陆长风意外穿越北宋，沦为地位低微县衙仵作。刚穿越便收到无名尸留下的夺命字条，县令寿宴当夜满门九人离奇中毒身亡，他遭人栽赃陷害，凭借专业尸检知识洗清嫌疑，揪出背负灭门仇的余家三兄妹。后续接连破解书生悬梁假死、藏冰涧南唐冰尸等连环奇案。办案途中结识一身正气、武艺高强的大理寺少卿沈清棠，又收下擅长画像的孤女慕朵朵做助手。一桩桩凶案背后，牵扯前朝玉玺秘辛与乱世旧怨。

三法司主理叶凡遇到被辞退的小仵作贺兰，发现贺兰擅长通过高超验尸手法找到案件突破口，叶凡也在贺兰的协助下找到案件的真相，两人在搭档探案中生出感情，并携手揭露了反派boss叶衡利益熏心、谋逆夺权的真面目，维护了龙都城的太平。

商贾巨富宋清安乃是法医宋慈后人，家有独女宋念慈，可是念慈不喜胭脂水粉、琴棋书画，偏偏喜欢研究各种尸体，让尸体开口说话，找到隐藏在尸体背后的秘密，宋念慈当上了一名小仵作，运用红伞验尸、起尸术、蒸骨拓伤等等宋家绝学，以骷髅案为切入点，成功找到并揪出一起起横贯十余年的大案件，法医界宋家绝学能否在一位纨绔千金的手里发扬光大，让我们拭目以待！

“御前大仵作”宋邵被贬流落到临安县成为无品无级的师爷，却被一具死后分娩男婴的女尸和一具腰斩的男尸重新拉回了敛房，再次操起了法医仵作的行当。虽然在知府何世琮和县令邹庆之的双重压力下陷入两难之地，但宋邵依然化身“法医神探”，通过验尸发现线索，抽丝剥茧竟然查出这小小的临江县隐藏着一个杀害十六对母子杀人恶魔，但是正当宋邵坚持的正义得以伸张，杀人恶魔被揪出之时，更大的阴谋和杀人事件慢慢浮出水面……