清源堂名医谷风之子意外溺水身亡，谷老太归咎于管家房成。房成心中不快，恰逢他与有夫之妇何秀所生女儿蔷薇无处寄养，故将谷风寄养在外的女儿忍冬与其掉包。蔷薇被带回谷家，成了掌上明珠，而忍冬则被送到何秀处，在贫寒困苦中长大。忍冬机缘巧合下来到清源堂工作，与同样命运多舛的韩冲相识。她乐观的天性和医学天赋，很快赢得了众人的喜爱，甚至蔷薇暗恋多年的正定，也对忍冬渐生好感。房成得知忍冬身份后，陷害忍冬，谷老太因此对忍冬处处刁难。蔷薇获悉真相后，为保住自己地位，也不惜一切代价力图阻止忍冬重回谷家。在韩冲和正定的帮助下，忍冬凭借自己不懈的努力，化解了种种危机和困境，成为妇孺皆知的女大夫。房成阴谋败露，最终忏悔伏法，谷家父女终于得以团聚 。

房成是清源堂名医谷风雇佣的管家，谷风之子意外溺水身亡，谷老太把过错归咎于房成，这让房成极为不满。为报复谷家，房成将自己和姘头何秀所生之女蔷薇，与谷家千金忍冬掉包。从此，私生女蔷薇成了谷家掌上明珠，过着衣食无忧的生活，而忍冬则由何秀抚养，在赤贫环境中长大。 多年过去，忍冬和蔷薇都出落成了亭亭玉立的少女。机缘巧合下，忍冬以学徒身份重回清源堂，在那里邂逅了名叫韩冲的男子。蔷薇一直爱慕正定，可正定却逐渐被忍冬的聪慧勇敢吸引，这使得蔷薇对忍冬充满憎恶。

影片讲述了老中青三代警察合力追凶的故事。两起杀人案在98年的回天市发生，警方决定成立调查小组去调查这一系列棘手案件。派出所警员陈育新接手案件，然而案件并不在此处停止。

影片讲述了老中青三代警察合力追凶的故事。两起杀人案在98年的回天市发生，警方决定成立调查小组去调查这一系列棘手案件。派出所警员陈育新接手案件，然而案件并不在此处停止。

某一日，对生活毫无干劲，只知道在网上购物的颓废男樱田纯（真田麻美 配音）收到了一封写着“上发条”和“不上发条”的信，好奇的他选择了前者，没想到，就因为这无意中的选择，一个充满神奇和争斗的残酷世界向他打开了大门。 　　名叫真红（泽城美雪 配音）的人偶出现在了纯的面前。原来，在百年之前，人偶制造的技术由于“蔷薇圣母”的发现而突飞猛进，于是，7个有自己的意识和思维的人偶诞生了。可是，制造者并不满足于此，他希望能够制作出最完美的人偶——爱丽丝，而怀着对制造者的爱，一场激烈的，夺取蔷薇圣母成为完美爱丽丝的战争在7个人偶之间展开。此时，新一轮的争夺即将开始，作为真红的新主人，纯会开始怎样惊险的冒险呢？

樱田纯是一名不愿上学而长期不出家门的中学生，热衷于上网购物，喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。有一天收到一封自称是人工精灵荷里耶的来信，上…

樱田纯，一名不愿上学而长期宅在家里的中学生，热衷于上网购物，并喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。某天他收到一封奇怪的信，上面写着“上发条还是不上发条”的选项，纯在好奇心驱使下选择了“上发条”，之后房间里凭空出现了一只没有署名的神秘皮箱，里面装着一个非常美丽而且质感近似真人的少女人偶。使用木箱内的发条转动背部的开关后，人偶竟像有生命般活动起来，并向纯介绍自己：“我是真红，蔷薇少女的第五人偶。”这时，小丑布偶突然前来袭击，纯在在不明白怎么回事的情况下莫名其妙地成为了真红的媒介，结下了主仆关系。之后，另一对结下类似契约的人类和人偶出现在纯和真红面前，被称为Rozen Maiden（蔷薇少女） 的人偶们的战斗就此展开了……

时间从初中直接跳到了大学。虽然课还有去上，打工也有做，纯依然还是过着家里蹲般的生活。某日在打工的店收到退回来的一本教导如何制作人偶的神秘杂志，…

水银灯和真红两人从最初相遇到反目成仇的过程。共前、后两篇。

《薔薇少女 ～序曲～》作为TV动画的特別篇于2006年12月22、23日深夜播出，主角是水銀燈和真红，介绍两人从最初相遇到反目成仇的过程。共前、後兩篇。