很久以前，数码世界中人型，兽型数码兽发生冲突，战争不断。光明兽平息了这场战争，成为数码世界的统治者。后来他变得专制，不断地虐待其他数码兽，被古代十斗士封印在黑暗区域，封印光明兽后，古代十斗士留下斗士之魂，交付给三大天使掌管，此后数码世界在三大天使的统治下得到和平。光明兽用邪气感染了基路比兽，并且很多数码兽被基路比兽感染而变得残暴，不断吞食数码世界数据。基路比兽将自己拥有的五个斗士之魂，做出了五位邪恶斗士神圣天女兽向现实世界求 救，有些接到电话的孩子们进了数码世界。

拓也一行人意外地卷入到彷徨之岛上的人型数码兽和兽型数码兽的战争当中。势不两立的两个种族的孩子们，却是十分要好的朋友。战争不可避免地打响，孩子们却发现，两族的头领贞德兽和马鹰兽竟然拥有相同的饰物，而传说中小岛的守护神——奥尼斯兽的背后，隐藏着一个惊人的秘密和阴谋……神原拓也他们到了数码世界的一个浮起的岛——彷徨之岛，这个岛上的人型数码兽和兽型数码兽是完全对立的关系，人型的数码兽帮助了拓也、友树和纯平，而兽型的数码兽则协助辉二和泉，拓也和辉二竟就此打起上来， 后来因其它数码兽哭了起来而停止。人型的剑道兽，与兽型的小熊兽是好朋友，他们说起了古代的数码兽，认为如果他们仍然存在的话，必定可解救这个岛。两种型态的数码兽再次战争， 拓也进化成炎龙兽，而辉二则进化成野狼兽，制止战斗。 后来纯平与小泉他们竟发现人型的领袖与兽型的领袖竟是同一只数码宝贝梅路梅克斯兽分别变身而成的两只数码宝贝，而它更令古代的数码宝贝奥尼斯兽复活，意图统治数码世界，就在众人绝望之时，剑道兽和小熊兽向刻有古代暴龙兽和古代加鲁鲁兽壁画的遗迹祈祷，古代暴龙兽与古代加鲁鲁兽竟然复活了！并且帮助拓也等人打败了奥尼斯兽，制止了这次危机。至此，彷徨之岛的人型数码兽与兽型数码兽的战斗就此划下了句号。彷徨之岛也变得不再彷徨了。在剧场版中复活并且帮助拓也等人打败奥尼斯兽的古代数码兽之一在剧场版中复活并且帮助拓也等人打败奥尼斯兽的古代数码兽之一人型数码兽的首领，梅路梅克斯兽所幻化的的人型数码兽。兽型数码兽的首领，梅路梅克斯兽所幻化的的兽型数码兽。贞德兽与马鹰兽都是梅路梅克斯所幻化出来的数码兽。真实目的是想借助数码兽们的数据来复活古代数码兽——奥尼斯兽。借助奥尼斯兽的力量来统治数码世界。最终被古代暴龙兽和古代加鲁鲁兽复活后联手击败在古代被古代暴龙兽和古代加鲁鲁兽击败的古代数码兽。梅路梅克斯兽将其复活。后因古代暴龙兽和古代加鲁鲁兽的复活，而被两者联手打败。

很久以前，数码世界中人型，兽型数码兽发生冲突，战争不断。光明兽平息了这场战争，成为数码世界的统治者。后来他变得专制，不断地虐待其他数码兽，被十…

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2020年，网络对于如今人们的生活而言已经是不可或缺的一部分。但是，人类所不知道的是，在网络的另一面有着一个无限的世界——数码世界，以及居住在其中的数码兽……以首都圈为中心发生了大规模网络故障，乱闪的信号灯、乱码的室外屏幕……新闻上报道是网络恐怖袭击。故事的主人公是住在东京近郊高层公寓的小学五年级生八神太一。为了准备周末的夏令营而一个人留在家中，去涩谷的母亲和妹妹八神光乘上了一辆无法停止的电车。为了救母亲和妹妹，太一急忙赶往涩谷，当他前往车站月台的瞬间发生了不可思议的现象，太一去了数码世界！孩子们与搭档数码兽相遇，一同面对未知的“冒险”！

数码宝贝大冒险2020动画全集为该系列完全新作动画，于2020年4月起开播，主角为小学五年级的八神太一和亚古兽。 「数码宝贝」系列在2019年迎来了20周年纪念，而此次的新作动画就是作为其总结而诞生的。本次的新作动画将从2020年以首都为中心爆发大规模网络故障开始，居住在东京近郊、准备参加夏令营的小学五年级生·八神太一，在得知母亲和妹妹搭乘了无法停止的电车后，想要帮助她们的太一在前往涩谷时进入了网络对面的数字世界，与其他被选中的孩子们一起开始了这场未知的冒险。

因战争连年，地球环境遭到破坏以致频临灭亡，人类被迫离开地球，五百年来一直生活在巨大太空船内的城市中；主控城市的电脑系统为免人类重蹈覆辙，特意隐瞒实情，让人类生活在虚拟二十世纪的社会中。飙车族矢作省吾从不关心社会及世界事物；他与同伴每天都在玩乐及飙车。直至有一天，他的一位旧朋友把一部神秘的超级电单车留了给他。这部名叫格兰度的超级电单车原来隐藏着一个重大的秘密。利用这部电单车，省吾发现了人类原来一直生活在巨大的太空船内，由一部名叫巴哈姆的超级电脑系统操控着…

省吾们回归数百年后的时代。 人们曾住在被电脑系统控制的“伊甸园城”街道上。 那是为了不重犯过去人类的错误而采取的手段。 但是，讨厌其统治的抵抗组织开始了反攻作战。而被曝光的统治者旺达的真实身份就是矢作省吾。 回到地球的时候，那些不承认他是7G操作员的创造者们，害怕的不是虚拟的而是人类——原创A和他的接触，变成了系统的傀儡Pownday。省吾在从其统治下解放后不久，就把后人托付给了本作品的主人公——艾季塔卡纳卡而死。 知道这一点的eve单身前往A.D.A.M .。 为了拯救人们......