1997年的方圆市，正在读小学三年级的时光在爷爷的杂物间里翻出了一个旧棋盘，恰逢此时出现了百年一遇的天体现象，超新星爆发，将来自南梁的棋神褚嬴通过棋盘带到了时光的身边。所有人都看不见褚嬴，除了时光。褚嬴为了寻找“神之一手”，和时光达成合作关系，借助时光的手来下棋。两人在黑白问道棋馆遇见了同样年纪的“围棋神童”俞亮，并赢下了这一局。褚嬴感慨俞亮小小年纪，但实力不凡，而俞亮只得知时光是第一次下棋，大为震惊。时光也因此开启了自己和围棋一生的羁绊。

进藤光是一个小学6年级学生。有一天，小光跑到爷爷家里寻宝，想赚些零用钱，没想到偶然翻出了一个旧棋盘。就在他接触棋盘的一瞬间，竟看见了附身于棋盘中…

佐为已离开，但光的围棋生涯还在继续。接续动画版的剧情，这部是之后推出的OVA，讲述了这群年轻棋手们的北斗杯之旅。 　　经过一番努力和征战，进藤光（川上伦子 配音）终于成为了一名职业棋手，这是对自己能力的认可也是全新的开始。成为职业棋手后的光从棋院那得知了北斗杯的消息，这是为18岁以下的年轻人举办的围棋赛，会有来自中国、韩国等围棋强国的青少年参与。兴致勃勃的光把这个消息告诉了塔矢亮（小林沙苗 配音），亮听到后一脸淡然的说自己已经是北斗杯确定的参与选手了。而光还得参与预选赛，才有资格和亮一起站在北斗杯的现场，通往北斗杯之路就此拉开。