Nemo is lost and once again his father, Marlin, is trying to find him. We join in on this adventure along side Nemo and Squirt as they play amongst a ship wreak, the sea floor, gorgeous coral reefs, a school of jellyfish, a mine field, and a pod of whales.

主角是一对可爱的 小丑鱼（ Clownfish）父子。父亲玛林本来有一个幸福的家庭，但在一场意外中妻子珊珊和大部分孩子都被鲨鱼吃掉，只剩下唯一的儿子尼莫。他们一直在澳洲外海 大堡礁中过着安定而"幸福"的平静生活。但在那巨大的打击后鱼爸爸玛林一直谨小慎微，行事缩手缩脚，虽然已经身为人父，却丝毫不会影响它成为远近闻名的胆小鬼。也正因为这一点，儿子尼莫常常与玛林发生争执，甚至有那么一点瞧不起自己的父亲。直到有一天，在父亲玛林的不信任眼神中，游向了停在海上的游轮底部。正当尼莫回返时，却被潜水员捉住了。并将它带到了澳洲 悉尼湾内的一家牙医诊所。在大堡礁的海底，心爱的儿子突然生死未卜的消息，对于鱼爸爸玛林来说却无异于晴天霹雳。尽管胆小怕事，如今为了救回心爱的孩子，玛林也就只有豁出去了。它决心跟上澳洲 洋流，踏上寻找自己儿子的漫漫征程。虽说是已下定决心，但这并不代表玛林可以在一夜之间抛弃自己怯懦的性格。途中与 大白鲨布鲁斯的几次惊险追逐，很快便令它萌生退意，险些使父子重聚的希望化为泡影。但幸运的是，玛林遇到了来自撒马力亚（ Samaritan）的 蓝唐王鱼（ Regal Blue Tang）多莉（ Dory）。多莉是一只热心助人、胸怀宽广的大鱼。虽然严重的健忘症常常搞得玛林哭笑不得，但是有多莉在身边做伴，却也渐渐令玛林明白了如何用勇气与爱战胜自己内心的恐惧，也懂得了一生中有一些事情的确是值得自己去冒险去努力的道理。就这样，两条鱼在辽阔的太平洋上的冒险使它们交到了形形色色的朋友，也遭遇了各式各样的危机。而鱼爸爸玛林也终于克服万难，与儿子团聚并安全地回到了自己的家乡。过去那个让自己儿子都瞧不起的胆小鬼玛林，经过这次的考验后成为儿子眼中真正的英雄！一场亲情团聚的大戏，就此在充满泪水的眼睛中落下了帷幕。

全套内容围绕小丑鱼马林和尼莫的深海冒险双线展开，从尼莫因调皮被人类潜水员抓走，到马林跨越万里海洋、结识健忘蓝唐王鱼多莉，一路闯过鲨鱼聚乐部、水母群、东澳洋流等重重难关，情节跌宕起伏又充满童趣。画面细腻还原珊瑚礁的斑斓、蓝海沟的幽深、海龟群的灵动，鲜活呈现数十种海洋生物的形态与习性。故事不仅传递父爱如山的温暖，更教会孩子勇敢面对困境、珍惜亲情与友谊，潜移默化普及海洋保护的小知识。

多莉（艾伦-德杰尼勒斯 配音）是太平洋中一条年轻的帝王蓝刺尾鱼，她的母亲珍妮和父亲查理一起帮女儿应对短期记忆丧失的问题。一天，她发现自己在海洋中…

这天，道歌教练安排了一个任务给水下摩托艇石头两只受训潜水艇——贝贝和与阿力，那就是先将海参们放回珊瑚堆，然后找到一个合适的箱子，去将飞机苏茜运来的鳗鱼运回培训基地。三个小伙伴一开始为了争夺负责人，几乎搞砸了所有事。后来他们认识到自己错了，于是齐心协力终于完成了任务。潜水艇贝贝和阿力这天毕业了，毕业之际，他们回想起自己接受潜艇训练的点点滴滴：为救教练潜到20米、与油妈交换工作……这当中不仅使他们懂得了做事的道理，还令他们收获了可贵的友情。

深深海基地由于被传说中海怪袭扰启动了抓捕计划，逗号却发现海怪其实只是一只可爱的小龙，在逗号和小伙伴的不懈努力下终于化解了海怪的误解，并让小龙和龙妈妈重聚。

阿力和贝贝都是优秀的科研小潜艇，他们是一对非常好的拍档，在《潜艇总动员》中，他们共同完成了很多次的训练和任务，这一次，两个小家伙将面临什么样的…

杀人恶魔现在重归！海洋又一片杀戮！

一艘即将退役的柴油潜水艇，却要值勤，对道吉上校来说简直是个噩梦，偏偏又遇上严厉的军纪官马丁老是和他作对。除了马丁之外，道吉还得面对一位想争夺指挥的风骚女军官，外加一群经常出状况的海军菜鸟。一艘破潜艇和一群头痛的人物，再加上一位连道吉执行秘密任务都要干涉的海军上将，然而潜艇里的人，也因这个秘密的潜艇任务，把这里的一切弄得鸡飞狗走，笑料百出。