在企鹅教授和海豹镇长的宣传带领下，海底社会认同了“外星人有害论”的观点。小潜艇阿力偶然遇到来地球游玩却和父母走散的小外星人WUGU，通过了解阿力发…

在海豹镇长和企鹅教授的宣传带领下，海底社会认同了“外星人有害论”的观点。小潜艇阿力偶然遇到来地球游玩却和父母走散的小外星人Wugu，通过了解，阿力发现外星人不但不危险，还很友好。为了帮助Wugu找到父母，阿力和朋友贝贝踏上了冒险的旅程……

这天，道歌教练安排了一个任务给水下摩托艇石头两只受训潜水艇——贝贝和与阿力，那就是先将海参们放回珊瑚堆，然后找到一个合适的箱子，去将飞机苏茜运来的鳗鱼运回培训基地。三个小伙伴一开始为了争夺负责人，几乎搞砸了所有事。后来他们认识到自己错了，于是齐心协力终于完成了任务。潜水艇贝贝和阿力这天毕业了，毕业之际，他们回想起自己接受潜艇训练的点点滴滴：为救教练潜到20米、与油妈交换工作……这当中不仅使他们懂得了做事的道理，还令他们收获了可贵的友情。

深深海基地由于被传说中海怪袭扰启动了抓捕计划，逗号却发现海怪其实只是一只可爱的小龙，在逗号和小伙伴的不懈努力下终于化解了海怪的误解，并让小龙和龙妈妈重聚。

阿力和贝贝都是优秀的科研小潜艇，他们是一对非常好的拍档，在《潜艇总动员》中，他们共同完成了很多次的训练和任务，这一次，两个小家伙将面临什么样的…

杀人恶魔现在重归！海洋又一片杀戮！

一艘即将退役的柴油潜水艇，却要值勤，对道吉上校来说简直是个噩梦，偏偏又遇上严厉的军纪官马丁老是和他作对。除了马丁之外，道吉还得面对一位想争夺指挥的风骚女军官，外加一群经常出状况的海军菜鸟。一艘破潜艇和一群头痛的人物，再加上一位连道吉执行秘密任务都要干涉的海军上将，然而潜艇里的人，也因这个秘密的潜艇任务，把这里的一切弄得鸡飞狗走，笑料百出。

科研潜艇“逗号”，是科幻小说《地心游记》的铁杆粉丝。为研究海底神秘物质, 跟着叔叔地质学家 “铁石号”深潜马里亚纳海沟，意外被卷入洞穴迷宫来到巨大…

逗号在对突然出现的史前文明高能晶体展开调查时，意外唤醒了被封印的巨型海怪，海怪开始吸取地球所有的能量，地球危在旦夕！危机关头潜艇探险队在史前文明守护金刚的帮助下，再次封印了海怪，保护了地球的安宁。