少年夏驰天性纯良、聪明缜密，是学校推理社的成员。在一次推理社活动之后，接触过“季陆案件”的夏驰女友——晴知神秘失踪，为了寻找晴知，夏驰和好友孟…

动画「端脑」改编自国内漫画家壁水羽的同名漫画，故事从一个看似普通实则充满不可思议的未解杀人案开始，盘根错节，步步惊心，主人公们身陷其泥淖深渊无法逃脱，只有反守为攻寻找真相。就在主人公们锲而不舍的追查中，他们逐步揭开了掩藏在整个宇宙中的巨大秘密……而“端脑”正是被用来描述由两个平行宇宙空间所构成的庞大系统。