张珣天生阴命，身负大邪之物，难以活过十八岁，好在遇师父可助其渡过难关，可就在张珣离十八岁还剩三个月时，师父却突然失踪，张珣只能在师娘的提议下，坐堂阴阳医馆，收集三件邪物布阵镇压体内凶物，而在搜集邪物的过程中，张珣发现自己的师父失踪并不简单，一桩桩阴谋接踵而来。

上古世界，人妖共存，三界之中开有一间医馆，只医妖不救人。传闻医馆两人一兽，掌柜医师红 娘风情万种，助手叁池娘炮一枚，杂役多肉（蛤蟆精）人面妖身。 原本风平浪静的妖医馆，却因为一位不速之客书生金志坚的到来，陷入危机。书生怀孕，本是奇闻，奈何妖种竟是稀世魔丸。红娘本欲为其接生，取魔丸心头血方能破解自身命格缺陷，不想经过几日对魔丸的悉心照料，一人一兽产生情谊。红娘决意放走魔丸，却遭遇悬甲门围堵。原来一切都是掌门雄魁的计谋，他要用魔丸心头血培养嗜血菱花，以吸食妖族血脉为自身延寿，至此，红娘陷入绝境……

随着自家医馆一起穿越到秦岭深处的李中孚，还没搞清楚状况就被史上最稳太子朱标找上门儿。 原来医馆的门连接着千千万万个门，千万里外乃至其它世界的人都可以通过某扇被赋予随机穿越功能的门来到医馆求医。 什么？常氏要难产而死？那必须救啊！ 李中孚的种种奇异之处，引起了朱元璋注意，没过几天，他也经常来医馆串门了。 又过了几天，永乐二十二年即将病逝榆木川的永乐大帝朱棣也

心怀仁心的青年医生林深，坚守行医初心，体恤贫苦百姓，平价赠药暖心问诊。他低调隐藏豪门身份，默默坚守医德底线，却遭同行排挤算计，还被受助百姓误解非议。纵使世间人情凉薄，他依旧不改医者赤诚，揭穿黑心医者真面目，坚守正道弘扬医德，以仁心仁术温暖世间。

名医陆晨回乡开设平价医馆，遭大伯堂哥排挤夺权。二人无证售假药险些伤及村民，陆晨转至镇医疗中心救人。后在苏婉协助下搭建乡村医疗枢纽，直面资本恶意收购，坚守基层平价行医底线，作恶亲戚也依法获惩。

五百年前的大明京城，一家小医馆里生活着一群乐呵的年轻人。一天，医馆馆主离奇失踪，徒弟朱一品随后收到一个卷轴，无意中打开后，天生的神速记忆让他快速阅读并记下了卷轴的内容，之后就晕厥过去，卷轴也随之烧成灰烬。东厂西厂得知后，派麾下高手杨宇轩与柳若馨前来医馆卧底查探卷轴里的秘密，阴差阳错，他们和朱一品卷入一个个离奇案件。新人入局，也打破了医馆往日的平静。柳若馨年轻貌美，杨宇轩高大英俊，朱一品、赵布祝似乎都被柳姑娘所吸引，陈安安故意要跟杨宇轩亲密互动，期间杨宇轩的前女友、锦衣卫副千户聂紫衣也进来搅局，无数种可能都在小小的医馆里悄悄发酵。朱一品带领的医馆神探小分队踏上冒险之旅，披荆斩棘，将一桩桩迷案及其背后的惊天秘密一一揭开 。

赵怀山因为身体原因患上无精症，和妻子蒋丽茹到了中年也怀不上孩子。蒋丽茹为了照顾丈夫身体，在老家维持着自己的“古法医馆”，时不时就有城里慕名而来的大老板前来体验，夫妻俩的生活也有滋有味，但让赵怀山疑惑的是，每次妻子对客户进行治疗，都让自己回避，并且离得非常远，这让其格外疑惑。后来在一次和好友的酒局上，他无意间听到“借种”一事，意识到妻子极有可能就在做这样的事情。在好奇心的驱使下，他想尽一切办法，也要弄清楚蒋丽茹究竟在瞒着自己，在那间医馆中做什么。

前外科医生元瑶因医疗事故回乡躺平，暴雨夜为黄鼠狼剖腹产救活三崽，从此踏上精怪行医路。狐族少主中邪鳞命悬一线，她硬核拔鳞缝合赢全山信任。邪道囚山神布抽灵阵，元瑶以医者之眼破阵救神。复职文件寄到时，她看着满院报恩的“毛茸茸”和姥姥亲题的木牌，笑着推回：此生愿以手术刀，守护这一方生灵。

京城突现夺心狂魔，频频作案杀人而后夺走心脏，杨宇轩奉命捉拿凶手，期间为保护朱一品不幸葬身火海。朱一品悲痛万分，发誓要为杨宇轩报仇。皇帝突发恶疾，面向全社会寻找神医，朱一品怀疑夺心狂魔就隐藏在宫闱之中，毅然揭下皇榜入宫。经过一番艰苦调查，朱一品发现太医郑载农就是夺心狂魔，可惜最终被他趁乱逃跑。朱一品在寻找郑载农的过程中发现了宁亲王意图谋反的狼子野心，为此他与医馆同僚们几次三番被卷入凶恶险境，但都凭借默契的合作和日益进步的推理能力一次次成功破案，同时也将宁亲王的阴谋一点点揭露。最终，他们深入敌穴，再一次成功阻止了宁亲王的谋反行动，守护住了国家的太平 。

单身医女苏木木偶然捡到英俊僵尸夜无尘，一时心动将他扛回家悉心照料、肆意“折腾”，却不知他早已苏醒，默默守护在她身边。地痞骚扰、权贵刁难，夜无尘皆暗中出手相助，还与苏木木上演了诸多啼笑皆非的日常。随着相处，两人情愫渐生，苏木木发现了夜无尘的秘密，一场跨越千年的爱恋，在嬉笑打闹中悄然展开。