夏目教授带着他的考古团队，在长野县九郎岳的一处神秘遗迹里，发现了一口神秘的棺材。当他们打开尘封的棺盖后，释放出了恐怖的怪物。苏醒的怪物灭掉了整个考古团队的人，随后，就消失不见了。 这件事发生后，就开始了出现了一系列的怪事，可怕的未知生命体接二连三地出现。立志要守护大家笑容的五代雄介，在目睹了古朗基一号的暴行后，他决定戴上腰带，成为假面骑士空我。

夏目教授带着他的考古团队，在长野县九郎岳的一处神秘遗迹里，发现了一口神秘的棺材。当他们打开尘封的棺盖后，释放出了恐怖的怪物。苏醒的怪物灭掉了整个考古团队的人，随后，就消失不见了。 这件事发生后，就开始了出现了一系列的怪事，可怕的未知生命体接二连三地出现。立志要守护大家笑容的五代雄介，在目睹了古朗基一号的暴行后，他决定戴上腰带，成为假面骑士空我。

公元2000年。在长野山中的九郎岳，正在进行某座神秘遗迹的挖掘工作。当调查团将遗迹中的一具棺木开启时，突然遭到奇异生物的袭击而全数死亡。而在为了查出调查团被杀案件的线索，正在遗迹现场调查中的长野县刑警一条薰面前，有一名青年突然擅自闯入。这名被一条拦下的青年，他自称为冒险家五代雄介。 终于复活的未知生命体在长野近郊出现，并开始对人们肆意袭击，甚至一路冲进警局。在场的雄介感应到从遗迹出土，目前正由警方保管的腰带所传来的战士形象，在冒险家的直觉下将之着装于腰部。雄介的身体也随之覆上一层装甲，变身后的雄介与袭击警局的怪人经过一场苦战后终于将其击倒，从此雄介正式成为战士“空我”，并下定决心为了让周遭的人们免于恐惧，守护他们的笑容而战……

在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！

「来吧，开始实验吧。」 行星探测船从火星带回的神秘之箱“潘多拉魔盒”。 从箱中释放出来的能量创造出了巨大的墙壁，日本从此被分成了三部分。 10年后，在谜之怪人“猛击者”暗中活动的东都街头，传说存在着为了保护人们而战斗的假面骑士创骑。 他的真身是丧失记忆的天才物理学家·桐生战兔。为了解开潘多拉魔盒之谜，为了取回自己的记忆，他的战斗拉开了序幕……

「来吧，开始实验吧。」 行星探测船从火星带回的神秘之箱“潘多拉魔盒”。 从箱中释放出来的能量创造出了巨大的墙壁，日本从此被分成了三部分。 10年后，在谜之怪人“猛击者”暗中活动的东都街头，传说存在着为了保护人们而战斗的假面骑士创骑。 他的真身是丧失记忆的天才物理学家·桐生战兔。为了解开潘多拉魔盒之谜，为了取回自己的记忆，他的战斗拉开了序幕……

第一部分：假面骑士Decade ～完结篇～ 　　骑士大战终于开始，世界的破坏者Decade将假面骑士们逐一打败。夏海为了阻止士而和KIVA-LA订下契约，变身为假面骑士KIVA-LA与Decade展开战斗。最终，KIVA-LA一剑刺穿了Decade……各骑士的世界恢复了原样，但Decade的世界却消失了。哀伤的众骑士一起回忆与士并肩作战的日子，而此时，过去的士从各人的回忆中复活！另一方面，超级死神博士与佐鲁大佐、蜂女共同组建超修卡，并制造出Neo生命体杜拉斯…… 　　第二部分：假面骑士W ～Begins Night～ 　　鸣海侦探事务所这次受“风都”人气歌手安纱美所托，负责调查安纱美亡姐突然出现的不可思议事件。在调查过程中，已去世的前所长鸣海庄吉竟然出现在翔太郎他们的面前，并变身为假面骑士Skull与之战斗。在与庄吉战斗的时侯，翔太郎逐渐回忆起庄吉逝去的那一夜，也是他与菲利普共同成为W的那一夜…… 　　第三部分：MOVIE大战2010 　　Decade与W命运般地相遇，并与全平成骑士一同对战超修卡的巨大要塞！

《假面骑士Kuuga》完结后EPISODE1－2再编集版，对部分镜头重新整理，并增加TV版时没有的片段，同时配乐、配音和电脑特效的部分进行了新的制作，而且提升了画质。

战兔创造了新世界后，除了战兔和龙我外，所有人都失去了有关假面骑士、天空之壁等的一切记忆。然而某一天，突然从白色的潘多拉金属板中出现了一个未知的外星生命体，他利用龙我恢复了潘多拉魔盒，并企图利用魔盒的力量毁灭全宇宙，而拯救宇宙的重任竟落在了龙我和埃伯尔特的身上！

在桐生战兔创造的新世界中，只有接受过人体实验的人恢复了旧世界的记忆。而某位恢复了记忆的科学家成立了覆灭组织，并突袭了政府官邸，他企图利用骑士系统来统治新世界。 另外，覆灭组织利用一股不可思议的力量让冰室幻德、桐生战兔、万丈龙我失去了变身能力，并为了夺得白色金属板，而绑架了美空。现在唯一的希望就在还能变身的一海身上了。 一海将燃烧心火、救回美空，最后的狂欢就此开始！