時は戦国、織田信長は天下統一を着々と進めていた。しかし、それを阻まんとしている諸大名もまだまだ多数いた頃、南蛮貿易で富を誇る栄の町に「金目教」という謎の集団が出現した。 　　甲賀幻妖斎を首領とする金目教は、目的の為には手段を選ばぬ残酷な集団で一大勢力になりつつあった。 　　幻妖斎を支える部下は数知れずみな独特の術の使い手であった。栄の町は会合衆と呼ばれる人々で治められていたのであるが、会合衆は、金目教拡大を重く見て、飛騨の「忍者の里」にいる影一族に金目教の首謀者を捕らえるように依頼した。 　　この任務を任されたのが、飛騨忍者の「三つの影」青年忍者赤影、少年忍者青影、ベテラン忍者白影である。

在丰臣秀吉尚以木下藤吉郎之名行走于世的时代，琵琶湖南岸盛行着一个名为金目教的邪教。据传，那些拒绝信奉此教之人，将会遭受恐怖的诅咒。藤吉郎对教祖甲贺幻妖斋心存疑虑，遂从飞驒国召来了两位戴面具的忍者——赤影与青影。

本剧根据横山光辉的同名漫画改编。故事里，当织田信长的天下统一大业即将实现时，琵琶湖畔以南出现了一个叫《金目教》的诡异宗教。传言不信该教的人会遭到可怕诅咒。为了暗中调查《金目教》的真相，信长委派《假面忍者》前去。一名以忍者身份潜伏在暗处的青年（佐藤大树），最终变身为“假面忍者·赤影”。

本剧根据横山光辉的同名漫画改编。故事里，当织田信长的天下统一大业即将实现时，琵琶湖畔以南出现了一个叫《金目教》的诡异宗教。传言不信该教的人会遭到可怕诅咒。为了暗中调查《金目教》的真相，信长委派《假面忍者》前去。一名以忍者身份潜伏在暗处的青年（佐藤大树），最终变身为“假面忍者·赤影”。

時は戦国、織田信長は天下統一を着々と進めていた。しかし、それを阻まんとしている諸大名もまだまだ多数いた頃、南蛮貿易で富を誇る栄の町に「金目教」という謎の集団が出現した。 　　甲賀幻妖斎を首領とする金目教は、目的の為には手段を選ばぬ残酷な集団で一大勢力になりつつあった。 　　幻妖斎を支える部下は数知れずみな独特の術の使い手であった。栄の町は会合衆と呼ばれる人々で治められていたのであるが、会合衆は、金目教拡大を重く見て、飛騨の「忍者の里」にいる影一族に金目教の首謀者を捕らえるように依頼した。 　　この任務を任されたのが、飛騨忍者の「三つの影」青年忍者赤影、少年忍者青影、ベテラン忍者白影である。

在丰臣秀吉尚以木下藤吉郎之名行走于世的时代，琵琶湖南岸盛行着一个名为金目教的邪教。据传，那些拒绝信奉此教之人，将会遭受恐怖的诅咒。藤吉郎对教祖甲贺幻妖斋心存疑虑，遂从飞驒国召来了两位戴面具的忍者——赤影与青影。

为了世界的光明，赤影成为了影子武士。 　　在战国时期的骚乱中，赤影担负着成为影子武士一族首领的命运。 　　赤影为了和平而战斗着，然而，到底是执行影子忍者的使命，还是接受当权者的命令，赤影在夹缝中痛苦着挣扎，企盼能寻找到真正属于自己的道路……

2022年——乃是忍者活跃期间的年代。所谓的忍术，对于该年代的人们来说，那已经是个日常，但也是个充满了新的运动竞赛方式。平常只是作为月薪制的工薪族生活，总是展现出被妹妹称为 “废物的是只擅长忍术吧” 的让人吃惊程度地狼狈不堪的样子的青年：神藏莲太郎，他的另一个身份是与暗之忍者军团·虹蛇相战斗的传说的忍者·假面骑士Shinobi。这是一个暗中保护他人，斩除堕落者的年轻忍者故事。座右铭为——“忍字意为斩刃之心！”

2022年——乃是忍者活跃期间的年代。所谓的忍术，对于该年代的人们来说，那已经是个日常，但也是个充满了新的运动竞赛方式。平常只是作为月薪制的工薪族生活，总是展现出被妹妹称为 “废物的是只擅长忍术吧” 的让人吃惊程度地狼狈不堪的样子的青年：神藏莲太郎，他的另一个身份是与暗之忍者军团·虹蛇相战斗的传说的忍者·假面骑士Shinobi。这是一个暗中保护他人，斩除堕落者的年轻忍者故事。座右铭为——“忍字意为斩刃之心！”

时间是2023年2月。2022年3月开播的《假面骑士Shinobi》第46话迎来最终话！天草四郎时贞接管了今尾公司，并试图统治世界。与此同时，被吸入异界之门，来到忍者世界的影和和樱井纱罗兄妹，对满是忍者的风景感到困惑。来自世界各地的忍者骑手的相遇，是否会引发新的麻烦？！