在与39号战斗后的某天，完成店里工作的雄介翻阅起玉三郎的剪报，并回忆过往的战斗。而此时，40号野猪怪人Go·Jiino·Da出现了……

夏目教授带着他的考古团队，在长野县九郎岳的一处神秘遗迹里，发现了一口神秘的棺材。当他们打开尘封的棺盖后，释放出了恐怖的怪物。苏醒的怪物灭掉了整个考古团队的人，随后，就消失不见了。 这件事发生后，就开始了出现了一系列的怪事，可怕的未知生命体接二连三地出现。立志要守护大家笑容的五代雄介，在目睹了古朗基一号的暴行后，他决定戴上腰带，成为假面骑士空我。

夏目教授带着他的考古团队，在长野县九郎岳的一处神秘遗迹里，发现了一口神秘的棺材。当他们打开尘封的棺盖后，释放出了恐怖的怪物。苏醒的怪物灭掉了整个考古团队的人，随后，就消失不见了。 这件事发生后，就开始了出现了一系列的怪事，可怕的未知生命体接二连三地出现。立志要守护大家笑容的五代雄介，在目睹了古朗基一号的暴行后，他决定戴上腰带，成为假面骑士空我。

公元2000年。在长野山中的九郎岳，正在进行某座神秘遗迹的挖掘工作。当调查团将遗迹中的一具棺木开启时，突然遭到奇异生物的袭击而全数死亡。而在为了查出调查团被杀案件的线索，正在遗迹现场调查中的长野县刑警一条薰面前，有一名青年突然擅自闯入。这名被一条拦下的青年，他自称为冒险家五代雄介。 终于复活的未知生命体在长野近郊出现，并开始对人们肆意袭击，甚至一路冲进警局。在场的雄介感应到从遗迹出土，目前正由警方保管的腰带所传来的战士形象，在冒险家的直觉下将之着装于腰部。雄介的身体也随之覆上一层装甲，变身后的雄介与袭击警局的怪人经过一场苦战后终于将其击倒，从此雄介正式成为战士“空我”，并下定决心为了让周遭的人们免于恐惧，守护他们的笑容而战……

令和骑士？还早100年呢！ 　　镶嵌着历代假面骑士的驾驭凯米卡，以及假面骑士雷杰德的身姿，让人联想到某个与卡相关的假面骑士，那么假面骑士雷杰德究竟是何方神圣?

距海姆冥界在沢芽市的威胁过去数年──， 现在，新的危机迫近沢芽市──。 　　现在已经是世界级点心师，人气绝顶的城乃内秀保。跟随秘书鈴鹿まさこ，出演各种电视节目和签名会。看到城乃内的样子而担心的凰蓮桑，心中无法平静下来，这时接到了吴岛贵虎的佣兵任务，其内容竟然是是「收拾城乃内！」！ 　　剧中会登场假面骑士古列顿的新形态「荔枝装甲」，假面骑士Bravo 「榴莲王装甲」，迷之新骑士─假面骑士Sylphy，以及「舞台『假面骑士斬月』 -鎧武外伝-」里的斩月 胜哄装甲。

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乔治·狩崎为了协助Juuga驱动器的开发，听取与父亲真澄是旧朋友的研究员高田唱的咨询，来到了那个研究室。在高田给他看的视频中，发现了从收容所越狱了的欧鲁特加身姿…！