五百年前的大明京城，一家小医馆里生活着一群乐呵的年轻人。一天，医馆馆主离奇失踪，徒弟朱一品随后收到一个卷轴，无意中打开后，天生的神速记忆让他快速阅读并记下了卷轴的内容，之后就晕厥过去，卷轴也随之烧成灰烬。东厂西厂得知后，派麾下高手杨宇轩与柳若馨前来医馆卧底查探卷轴里的秘密，阴差阳错，他们和朱一品卷入一个个离奇案件。新人入局，也打破了医馆往日的平静。柳若馨年轻貌美，杨宇轩高大英俊，朱一品、赵布祝似乎都被柳姑娘所吸引，陈安安故意要跟杨宇轩亲密互动，期间杨宇轩的前女友、锦衣卫副千户聂紫衣也进来搅局，无数种可能都在小小的医馆里悄悄发酵。朱一品带领的医馆神探小分队踏上冒险之旅，披荆斩棘，将一桩桩迷案及其背后的惊天秘密一一揭开 。

故事回溯到五百年前的大明朝，繁华的京师之内，人来人往、熙熙攘攘，尽显盛世之象。京城的一角，有一家名为天和医馆的医馆，馆主陈幕禅（杨皓宇 饰）凭借专治疑难杂症的医术闻名京城，鲜为人知的是，他实则是西厂的特务。某一日，陈幕禅离奇失踪，立志成为御医的学徒朱一品（陈赫 饰）意外得到了一个至关重要的卷轴。大小姐陈安安因家庭变故悲痛万分，而卷轴的出现，将朱一品、其师兄弟赵布祝（佟磊 饰）以及陈安安一同卷入了一场前所未有的风波。东厂高手杨宇轩（王传君 饰）和西厂高手柳若馨（姜妍 饰）先后潜入天和医馆，两人在勾心斗角之中，也上演了一段段纠缠不清的儿女情长。

京城突现夺心狂魔，频频作案杀人而后夺走心脏，杨宇轩奉命捉拿凶手，期间为保护朱一品不幸葬身火海。朱一品悲痛万分，发誓要为杨宇轩报仇。皇帝突发恶疾，面向全社会寻找神医，朱一品怀疑夺心狂魔就隐藏在宫闱之中，毅然揭下皇榜入宫。经过一番艰苦调查，朱一品发现太医郑载农就是夺心狂魔，可惜最终被他趁乱逃跑。朱一品在寻找郑载农的过程中发现了宁亲王意图谋反的狼子野心，为此他与医馆同僚们几次三番被卷入凶恶险境，但都凭借默契的合作和日益进步的推理能力一次次成功破案，同时也将宁亲王的阴谋一点点揭露。最终，他们深入敌穴，再一次成功阻止了宁亲王的谋反行动，守护住了国家的太平 。

京城惊现夺心狂魔，频繁作案，杀人后夺走心脏。杨宇轩奉命缉拿凶手，在保护朱一品时不幸葬身火海。朱一品悲痛不已，发誓为杨宇轩报仇。此时，皇帝突发恶疾，面向全国招募神医，朱一品怀疑夺心狂魔藏于宫中，便毅然揭下皇榜入宫。经过艰难调查，朱一品发现太医郑载农就是夺心狂魔，然而郑载农趁乱逃脱。朱一品在追寻郑载农的过程中，察觉到宁亲王谋反的野心。他和医馆同僚们多次陷入危险境地，但凭借默契配合和不断提升的推理能力，一次次成功破案，同时逐步揭露宁亲王的阴谋。最终，他们深入敌营，再次成功阻止了宁亲王的谋反，捍卫了国家的太平。

余英男从小生活在小小村，她和哥哥余英奇都有着各自的秘密。英男并不知道她是被哥哥捡回家的女孩，因为她失去了年少时的记忆。而英奇的族人火黎族一直以医术救人，却因功法缺陷被江湖中人误解，族人们只能隐居小小村。英男以为自己十八岁生日那天遇到的苍墟大弟子白谷逸是梦中的大英雄。英男为了追求爱情，想上苍墟派学武，却错上蜀山。历尽波折之后，才恍然大悟，原来一路默默守护的英奇不是亲哥哥，英奇才是最值得自己深爱的人。哥哥英奇为了拯救自己被误解的族人，要寻找到江湖至宝赤魂石，英男却是那身怀赤魂石之人。英奇被白谷逸重伤，英男孤注一掷，借赤魂石之力救助英奇。白谷逸假正道之名企图灭掉火黎族，一场恶战，英奇最终还是与白谷逸同归于尽。英男继承英奇遗志，独自一人行走江湖，悬壶济世。

余英男从小生活在小小村，她和哥哥余英奇都有着各自的秘密。英男并不知道她是被哥哥捡回家的女孩，因为她失去了年少时的记忆。而英奇的族人火黎族一直以医术救人，却因功法缺陷被江湖中人误解，族人们只能隐居小小村。英男以为自己十八岁生日那天遇到的苍墟大弟子白谷逸是梦中的大英雄。英男为了追求爱情，想上苍墟派学武，却错上蜀山。历尽波折之后，才恍然大悟，原来一路默默守护的英奇不是亲哥哥，英奇才是最值得自己深爱的人。哥哥英奇为了拯救自己被误解的族人，要寻找到江湖至宝赤魂石，英男却是那身怀赤魂石之人。英奇被白谷逸重伤，英男孤注一掷，借赤魂石之力救助英奇。白谷逸假正道之名企图灭掉火黎族，一场恶战，英奇最终还是与白谷逸同归于尽。英男继承英奇遗志，独自一人行走江湖，悬壶济世。

余英奇的部族火黎族一直以医术救人，却因祖传的功法有缺陷而遭人陷害，被江湖中人误解并追杀，族人们只能隐居在小小村。妹妹余英男从小生活在小小村，因…

来自公元2032年的小人物欧阳竞意外被带到蜀山世界，卷入天狐超劫的危机，最终凭着永不放弃的决心力抗众恶，为救所爱之人，不惜牺牲了自己，获得了真爱。

蜀山派是江湖第一名门正派，一直领导武林多年。蜀山掌门诸葛驭我为保天下，与企图抢夺赤魂石的蜀山派弃徒绿袍尊者展开争斗。六星之子丁隐本是卧云村的普通猎户，因魔宗屠村血案而被救上蜀山。却在机缘巧合下将赤魂石炼化入体，天赋秉异的丁隐由此拜入蜀山门下修习剑法。失忆的丁隐发现绿袍之女玉无心竟然与他逝去的爱妻长得一模一样，二人坠入情网。此时，蜀山派内部亦暗流涌动，与魔宗勾结的“山中人”暗中兴风作浪。封印天域妖魔的蜀山结界阵眼“南明离火”神剑被玉无心带走，为加固天域结界，掌门诸葛驭我派遣丁隐、丹辰子、诸葛紫英、周青云及张馅饼下山，寻找传说中的神木、青索、紫郢三把神剑。丁隐等人历经艰难险阻取得神剑，不想却陷入更大的阴谋，令众人分崩离析。同时，魔宗与蜀山派的争斗越来越惨烈，绿袍尊者带手下攻上蜀山。面对重重阴谋背叛和一触即发的终极大战，丁隐和玉无心爱恨两相难，正邪一念间。最终他们选择拯救天下苍生。

蜀山派弟子丁隐（陈伟霆 饰）体内被掌门诸葛驭我打入传世珍宝赤魂石。诸葛驭我看中丁隐天赋异禀，欲将其培养成武林高手，以此打败宿敌绿袍尊者（吴奇隆 饰），为武林除去这一祸害。 一次机缘巧合，丁隐邂逅了名为玉无心（赵丽颖 饰）的女子。令他大为震惊的是，玉无心竟与自己已逝的妻子长相一模一样。丁隐不由自主地爱上了玉无心，然而玉无心实则是绿袍尊者的女儿，两人陷入了痛苦的爱恋之中。 与此同时，蜀山派内部并不太平，各股势力心怀不轨、暗中较劲。丁隐和同门丹辰子（高伟光 饰）、诸葛紫英（刘思彤 饰）、周青云（文咏珊 饰）等人试图力挽狂澜，没想到却陷入了更为险恶的阴谋陷阱。