该剧讲述了秦始皇嬴政在吕不韦、李斯、王建等辅佐下，灭六国，统一天下，建立中国历史上第一个统一的中央集权国家的故事。
战国末期，已经混乱了五百多年的华夏大地依然战火纷飞，满目疮痍。当时六国弱小，秦国独大，天下统一的趋势渐渐显现。大商人吕不韦带着在赵国被扣为人质的嬴仪逃回秦国，年轻的始皇嬴政被抛弃，留在邯郸，经历了多次生死劫难，目睹了战争给人民带来的痛苦和绝望，一统天下的愿望由此诞生。此后，嬴政回到了秦国，在咸阳的政治漩涡中经历心灵的伤痛，蜕变成一个真正的王者。为了抓住统一天下的时机和力量，实现一统天下的理想抱负，他精心谋划，暗中行动，终于平定了来哀之乱，亲政，罢相，夺回了王权。之后又铲除宗室复辟势力，为东出灭国扫清了道路。在李斯、王建、蒙恬等一批文臣武将的协助下，灭掉了六国，建立了中国历史上第一个统一的中央集权国家。