《子时归兮》讲述了十一个夜幕降临后发生的奇幻悬疑故事。同学聚会合影中惊现的诡异身影，半睡半醒间不断响起的敲门声，一通来路不明的死亡通知电话……十一个怪诞诡奇的事件，打破了一个个平静的夜晚。

楚汉时期，项羽起兵，刘邦称雄。赵小坨和老发是项羽军中人，两人情同手足，称兄道弟。却在一次战争，老发为救小坨而腿部受伤。节节败退的项羽军队欲精简转战，遂决定抛弃军中伤兵。此时的赵小坨已成为将军眼前的红人，却令带伤的兄长老发冒死行刺刘邦……

林佳16岁生日宴上，一通电话彻底撕开了和睦家庭的面具。人人试探、猜疑、隐忍、包庇。在完美家庭和父亲之间，深受打击的林佳看不清自己的归处。

灵越仙君，原是天地间一株苍翠的竹灵，因邵华帝君一句“历劫归来与你定亲”，心头微动。未料，帝君爱宠红鲤鱼私自下凡，灵越为追回“定情信物”，毅然追入凡尘，却被司命君巧借天命，让她替代了邵华凡间妻子的身份，开启了一场长达数年的炼狱之劫。

扶溪从爷爷手中得到子时当铺传承，成为子时当铺新掌柜的这天，当铺内来了一个神秘老人。老人家中怪事连连，扶溪与老人签下当契，前往叶家解决诡异之事，却牵扯出一桩家族丑闻。一张当契，一件怪事，一颗叵测人心的事件。

一部新中式志怪短剧。志怪其表，人心其里——精怪皆是执念所化。青瓦古城，子时开张的当铺只收一样东西：执念。失忆三百年的守灯人沈灯，与柜上小妖阿荧，接待一位位“精怪来客”。它们的怨与善，桩桩照见人间遗憾。

初一与爷爷相依为命，守着祖上传下的子时药铺。每晚子时开门，三更关门，可初一从未见爷爷抓过药。直到那夜他偷偷去看，一个神秘女子找上门，求医“执念之症”，留下几句古怪线索便凭空消失。爷爷让初一立下契约，从此接手坐堂，并立下三条规矩：子时开、鸡鸣关，不可强解执念，不可乱说。李医生深夜求助，女儿回家后对着秋千独自唱歌，谁都看不见人。初一查出真相，以符纸相助，让母女完成最后告别。此后每晚，初一都能听见有人唤他名字，子时药铺的故事，才刚刚开始。

初一与爷爷经营“子时药铺”，专医执念人心。某夜，一女子求医，留下“南沟老槐，半夜钟鸣”便消失。爷爷让初一签下契约，立下三规：子时开、鸡鸣关；不强行化解执念；不乱说。随后李医生求助，女儿见不到他。初一发现李医生耗尽心血，祭符相助，母女终得告别。从此初一坐堂行医，却每夜听见神秘呼唤，故事未完。

初一和爷爷相依为命，经营着祖上传承的药铺，药铺每晚子时开门，三更关门，所以被称为：子时药铺。初一却一直疑惑，自己从未看到过爷爷抓药治病救人。于是夜晚，初一悄悄来到药铺，就此跟着爷爷开启自己继承祖业的道路。每晚，故事准时上演。