日本播放的《宝可梦》系列动画分为不带小标题的无印篇动画和附带小标题的其他六部动画，附带小标题的6部动画在设定上根据各自的游戏版本而有所不同，并未按照季度划分。

精灵宝可梦，简称宝可梦。 　　这个星球上有许多不可思议的不可思议生物。 　　空中、海中、森林中、街道中，你可以在这个世界的任何地方看到它们。 　　小智和皮卡丘继续着他们的冒险， 　　追寻着成为“宝可梦大师”的梦想。 　　与沿途的野生宝可梦相遇── 　　以及试图夺取皮卡丘的火箭队── 　　小智与皮卡丘在这样不变的冒险中过着每一日， 　　在某个森林中， 　　他们遇见了受伤的传说宝可梦·拉帝亚斯…！

《精灵宝可梦XY&Z》讲述主人公小智揭开从来没有任何人看到过的传说中的神兽Zygarde隐藏的秘密，并且与神秘组织“闪光团”展开激战的故事。小智的精灵甲贺忍蛙出现了不可思议的变化。

精灵宝可梦：世代是精灵宝可梦动画的短片系列，改编自每代的精灵宝可梦游戏。系列一共18集，每集长度3～5分钟，2016年9月17日（东8区时间）起每周于精灵宝可梦海外官方Youtube频道首播。

宝可梦25周年纪念动画《宝可梦进化》（Pokémon Evolutions）。讲述8个地区的训练师和宝可梦一起成长的故事。

『ピチューとピカチュウ』のスピンオフ作品。ミレニアムタウンに住むポケモン・ピチュー兄弟を主人公としたシリーズ。 　　ぼくたちピチューブラザーズ・風船騒動の巻 　　ミレニアムタウンの秘密基地に遊びに来たピチュー兄弟。友達のムチュール・ブビィ・ウパー・ヒメグマたちと一緒に遊ぶが、ひょんなことで兄弟げんかが始まってしまう。ところがその騒動の最中に、気絶したピチュー弟がスケボーの上に落下、そしてスケボーは街に向かって走り出してしまう… 　　ぼくたちピチューブラザーズ・パーティはおおさわぎ!のまき 　　ピチュー兄弟のもとへ大慌てでやってきたムチュール。話によると、街のポケモンたちが三日月形の何かを持っているとのこと。謎を解くためにピチューたちは街へと向かうが…

被人类用基因技术克隆出来的最强宠物小精灵超梦（市村正亲 配音）带着对自我身份的疑惑和对人类强大的愤怒逃离了科研所，它宣布要对制造出自己的人类进行复仇。 　　已经得到了八个勋章的小智（松本梨香 配音），以成为宠物小精灵训练大师为目标而不断的旅行，他带着皮卡丘（大谷育江 配音）和同伴小霞（饭冢雅弓 配音）小刚（上田佑司 配音）刚结束了和训练家的对战，接着收到了一封神秘人的邀请函，邀请他们参加世上最强的小精灵训练家的宴会。地点是新岛宠物小精灵城，这是最强训练家的邀请。他们很痛快的答应了，小智一行人穿过了狂风暴雨的海岸终于到达了新岛。一位叫乔伊的医生带领他们来到了宠物小精灵城，介绍最强的宠物小精灵训练家出场。没想到出现在大家面前的竟然是超梦。超梦的报复究竟是什么呢，一场大战即将开始......

小智与皮卡丘新的冒险开始了！ 新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？ 新的精灵宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！ 去吧！全力！大冒险！！

小智与皮卡丘新的冒险开始了！ 新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？ 新的精灵宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！ 去吧！全力！大冒险！！

精灵宝可梦，不可思议的生物。可是，还没有人了解所有的宝可梦。以成为宝可梦大师为目标，继续着旅程的小智和伙伴皮卡丘在合众地区的冒险又开始了。新…