电影《荒村怨灵》改编自1945年湘西真实灵异事件，首度将“湘西赶尸”、“苗族蛊毒”等湘西苗地惊悚秘闻搬上大银幕。影片主创深入湘西山区和苗地古寨，发掘灵异蛊毒秘闻，寻访湘西赶尸传人，将“赶尸匠”、“摄魂铃”、“山中鬼域的蛊毒”等众多湘西苗地惊悚元素融合，再现神秘赶尸术，揭秘百年湘西赶尸传说的终极谜底。昼伏夜行的赶尸人、阴间路上回响的摄魂铃、使活人致幻死人坐起的苗地蛊毒、红衣轿中见之即亡的鬼新娘，众多灵异湘西秘闻将在电影《荒村怨灵》中首度灵现大银幕。

古朴而神秘的吴家村位于湘西雪峰山深处。村民敬神信巫，生活平静。1945年4月中旬，吴家村的平静忽然被打破了。村里开始不断出现诡异之事：村民吴振堂家蒸好的一桶米饭莫名其妙地不见了；村民竹竿家的衣服和长老吴茂吉家的腊肉也不翼而飞；更有村民铜罐子家的狗被人杀死在村路上；接着，吴振堂在河里发现了外出村民的尸体……这一系列怪事让淳朴的村民感到疑惑和恐惧。而这一切还只是开始，一个巨大的灾难正慢慢朝这个村子袭来……

小明（海俊杰）的四个朋友在黄山村玩过一次“招魂游戏”后先后离奇身亡，因直觉事有蹊跷，小明向当记者的姐姐CISSY（黎姿）求助，为获独家新闻，CISSY介绍对灵学颇有研究且暗恋自己的好友发毛（吴镇宇）给小明认识。 　　发毛与小明赶赴黄山村调查时，了解到该村在百年前曾发生过离奇惨案，其时被丈夫密谋杀死后得知自己死因的粤剧名伶楚人美（施念慈）曾在三天内害死该村66条人命，而现在她的阴魂又现是因尸骨被新建的工程抛入山边的潭中。经过更加深入的调查，两人发现女鬼杀人的手法实则是让喝过潭水的人产生幻觉后离奇暴毙，但是此时CISSY及丈夫已经喝过潭水，为救CISSY，小明和发毛先后喝过潭水跳入深潭。

警方追查色魔案件，派出了女警花生（陈炜 饰）引诱色魔。警员追捕色魔到某地盘，可是最后色魔被砍断了四肢而死，警员也离奇死亡了。花生与其警察男友一哥（王合喜 饰）咖啡（张慧仪 饰）所在的杂志社对此事件着手报道，他们买通警员阿图索取资料，可是不久负责此案件的记者也死去了。通灵小说家蓝精灵（万绮雯 饰）也加入到案件调查当中，这时花生的表姐也离奇死亡了，使案件更加耐人寻味。蓝精灵查出案件与一个叫华月媚的女子有关，没想到这个姓华的女子是花生的曾祖母。 　　刚开始一哥不认同案件与恶鬼有关，直到警员阿图也变得怪异起来。咖啡也常常看到很多奇怪的画面，似乎她与一切都有所联系。蓝精灵建议他们用催眠的方法勾起潜意识弄清事实，弄清一段隔世的恩怨情仇，当时冤死的恶鬼，要来讨回公道……

导演西蒙（张达明 饰）想要拍摄一部鬼片，于是委托助理阿梅（林雅诗 饰）寻找合适的拍摄地点。阿梅在荒郊野地里发现了一间尘封已久的古屋，是拍摄恐怖片的绝佳地点，在妥善移走了古屋中的骨灰坛后，剧组进驻古屋，开始了拍摄日程。 　　可是，在此期间，阿梅的身边开始接二连三的发生怪事，她的男友更是匪夷所思的丧生于车祸之中。被恐惧笼罩的阿梅找到了西蒙的女友珠珠（黎姿 饰），希望身为灵学专家的她能够替自己排忧解难。很快，珠珠就发现，当初骨灰坛里的恶灵竟然爱上了阿梅，不仅如此，它还附在了西蒙身上，想要和阿梅自杀“双宿双飞”。

警花花生调查色魔案件，但色魔及多名警员离奇死亡，事件开始变得复杂。花生未婚夫一哥与记者咖啡携手调查案件，花生好友亦死去。通灵小说家蓝精灵怀疑死者姐姐可能被恶鬼缠身，提议用催眠方法令她道出真相，谁知连恶鬼也唤醒了。原来恶鬼与众人有隔世冤仇，这回来到人间定要取众人性命！

警花花生调查色魔案件，但色魔及多名警员离奇死亡，事件开始变得复杂。花生未婚夫一哥与记者咖啡携手调查案件，花生好友亦死去。通灵小说家蓝精灵怀疑死者姐姐可能被恶鬼缠身，提议用催眠方法令她道出真相，谁知连恶鬼也唤醒了。原来恶鬼与众人有隔世冤仇，这回来到人间定要取众人性命！

导演SIMON（张达明饰）开拍鬼片，需要一间古屋作为场景，剧组年轻女助理制片MAY（林雅诗饰）奉命前往乡村寻找，终于找到一间破落不堪、无人居住的古屋，MAY发现古屋内有一个骨灰坛，好心的她将骨灰坛妥善移开，免得无意破坏冲撞神灵，剧组开进古屋拍摄。不料其后连连发生怪事，MAY的男友离奇死于车祸，她身边的人也一一遭遇危险，MAY更渐渐由清纯少女变得豪放欲艳，她怀疑自己被鬼魂缠身，遂向剧组化妆师珠珠（黎姿饰），珠珠是导演SIMON的女友，同时还是一个灵学专家。经过一番调查发现原来是MAY所移骨灰坛中的鬼魂爱上了MAY，他还附在SIMON身上，要与MAY双双自杀举行地狱婚礼，SIMON和MAY都已被恶灵控制，珠珠只好依靠自己力量来阻止这场冥婚……

导演SIMON（张达明饰）开拍鬼片，需要一间古屋作为场景，剧组年轻女助理制片MAY（林雅诗饰）奉命前往乡村寻找，终于找到一间破落不堪、无人居住的古屋，MAY发现古屋内有一个骨灰坛，好心的她将骨灰坛妥善移开，免得无意破坏冲撞神灵，剧组开进古屋拍摄。不料其后连连发生怪事，MAY的男友离奇死于车祸，她身边的人也一一遭遇危险，MAY更渐渐由清纯少女变得豪放欲艳，她怀疑自己被鬼魂缠身，遂向剧组化妆师珠珠（黎姿饰），珠珠是导演SIMON的女友，同时还是一个灵学专家。经过一番调查发现原来是MAY所移骨灰坛中的鬼魂爱上了MAY，他还附在SIMON身上，要与MAY双双自杀举行地狱婚礼，SIMON和MAY都已被恶灵控制，珠珠只好依靠自己力量来阻止这场冥婚……

在一个鬼村，荒芜一片，以前、现在，以及未来的时空混杂在一起，百余生命的痕迹依然保存在荒村中。