未来世界，灰心星球的大大怪和小小怪携带具有强大力量的五颗机械石侵略星星球，其中四颗和宇宙中流浪的四辆废旧机车意外结合，在宅博士的帮助下变成了开心超人、甜心超人、粗心超人和花心超人。从此，四超人为了守护星星球展开了有趣又爆笑的战斗。

《开心宝贝》第二部《开心宝贝之开心超人》，将延续第一部动画片诙谐幽默的轻松路线，继续讲述发生开心超人为首的超人战队和大小怪之间的故事。 《开心宝贝》第二部《开心宝贝之开心超人》中，宅博士决定将超人们正式送入校园——超星学院，与星星球的小朋友一样，在学校里面学习新的技能与知识。以开心超人为首的超人团队，又增添了新的一员——小心超人。五超人战队终于团聚。五个个性鲜明的超人带领下，一场充满勇气和爱心的超人与怪兽对战卷土重来。 第二部的故事围绕星际时代的校园生活展开，开心超人们一边要适应学校生活，一边要应对各种挑战。更有很多少年儿童熟悉的校园生活场景，让孩子们引起共鸣。比如一集《篮球大战》中，怪兽学院与超星学院决定以篮球一决胜负。小心超人身为灌篮王成为代表的得分主力。然而怪兽学院使出阴招，扰乱比赛的正常进行。超人们合作无间，团队精神发挥重要作用，漂亮赢得比赛...

黑色机械石变成的小心超人与其他四个超人集结，五超人去超星学院学习新的技能与知识。大大怪为了破坏超人们的学习计划，混入学校当校工，同时安排小小怪与超人们成为同班同学。司令寄来黑魔蛋帮助大大怪侵略星星球，最终五超人联手打败了大大怪。

开心超人除了保护星星球，更多是带领星星球居民寻找快乐。灰心星球在多年前曾经派出过大批的侵略军来到星星球，但因飞船失事，那些侵略军全都失散在星星球。大大怪和小小怪弄到了当年的名单，企图在星星球寻找当年的侵略军并唤醒他们，然后侵略星星球。

本片讲述了发生在开心超人为首的超人战队和敌人大大怪、小小怪之间的故事。五位超人们为了保护星星球，相比较在遇到危险时的激烈打斗，如何让居民安居乐业，享受平凡的幸福，似乎更有挑战性。大大怪和小小怪两个坏蛋也把目光投向星星球的平民百姓身上，觉得一步一步攻克星星球才是可取之路。过程中充满了危险和紧张，同时也有许多搞笑内容。

星星球球长遭遇大大怪新搭档——魔法师嚯哈哈的袭击导致昏迷不醒，只有找到风火雷冰四根魔杖，才能拯救球长。为此，超人们穿越到中古小镇，在国王和当地居民的帮助下，利用有限的线索寻找国师笑哈哈遗留的魔杖。大小怪通过嚯哈哈和其他魔法师的协助来到小镇，阻挠超人们寻找魔杖。

由狗统治的汪财星和由猫统治的喵美星都想和星星球建立联盟，于是各自派出亲善大使来星星球考察，并想办法拉拢星星球人。汪财星和喵美星是两个敌对的星球，他们同时来星星球的目的除了和星星球加强交流外，另一个原因就是为了不让对方好过。他们常常针锋相对，不断引发矛盾。超人们在继续守护星星球的同时，还必须防止汪财星人和喵美星人的争端引发星星球的危机。同时，两个大使的孩子就读超星学院，两孩子之间的争斗给校园增加了许多麻烦。

彼此敌对的汪财星和喵美星，为了和星星球建立联盟，分别派汪大使和喵大使出使星星球。两个星球的人针锋相对，矛盾不断。超人们在应对大大怪侵略的同时，还必须防止汪财星人和喵美星人的争端引发星星球的危机。在战斗中，战神伽罗为了守护星星球牺牲了自己。

星星球的人们发现了一个新星球--古灵星，它是一颗神秘的星球，上面蕴含着各种神秘的资源。校长和博士率领五个超人去探险，他们无意中探入了古灵星的地下城，探秘失落的文明。灰心星球司令派大小怪在探险队卧底，随时窃取探险的成果，并带回灰心星球。超人们一边应付新环境，一边应付来自暗处的各种破坏。

灰心星将军大大怪统领怪兽学院培养的怪兽侵略星星球，除了灰心星球外，其他星球也对星星球虎视眈眈。星星球陷入了群雄割据的局面，在五个超人的守护下，善良的星星球人们并不知道危险的降临。阿德里星的战神伽罗来到星星球，成为了小心超人的得力助手，一起为守护星星球而奋斗。