2006年の発売から根強い人気を誇るPlayStation2用ゲーム「ペルソナ3」をアニメーション映画化した「PERSONA3 THE MOVIE」の第3章。季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。

隐藏在每天交替时刻的狭缝中的时间，“影时间”。每当影时间来临，世界便停止运转，人们化为静立的棺木。之后，异形的怪物“Shadow”便现身破坏。能够与之对抗的，只有能够使用“Persona”这种特殊能力的人类。 转学到私立月光馆学园的少年结城理觉醒了Persona的力量，之后被前辈桐条美鹤邀请加入“特別课外活动部”。在那里聚集的，都是同样拥有力量的Persona使用者。他们为了各自的目的追寻着影时间的真相，并与难以想像的命运展开了对峙ーー。

隐藏在每天交替时刻的狭缝中的时间，“影时间”。每当影时间来临，世界便停止运转，人们化为静立的棺木。之后，异形的怪物“Shadow”便现身破坏。能够与之对抗的，只有能够使用“Persona”这种特殊能力的人类。 转学到私立月光馆学园的少年结城理觉醒了Persona的力量，之后被前辈桐条美鹤邀请加入“特別课外活动部”。在那里聚集的，都是同样拥有力量的Persona使用者。他们为了各自的目的追寻着影时间的真相，并与难以想像的命运展开了对峙ーー。 剧场版第二章“Midsummer Knight's Dream”登场。

唐，载初元年。越州城西坊出现一起好似招鬼仪式的诡异自杀案，越府少尹司文调查后发现死者是自己深爱过的女人——曾风靡一时的“花魁”柳招娣。从命案开始的七日起，弃婴化作鬼魅山神进行了一场蓄谋已久的报复……

大唐宝历年间，长安城内暗影潜藏、怪事频发，大理寺少卿顾千翎携手仵作段朝、护卫玉华接连调查鬼戏子案、冥婚案、纸妻案、活死人案等各种离奇诡案，然而案件的背后却是波云诡谲，两位少年不惧风雨，砥砺前行……

本片讲述水利专家申天一和同窗辛远航在古木村治理黄河水患问题时，遭遇了“逆水行尸”的诡异事件，并意外搭救了昔日伙伴余茵。几人同行合力探索黄河诡事背后的真相。申天一等人在重重谜团中层层分析、逐步揭开谜底，找到了科学治理水患之法，彻底让古木村恢复了和平。

本片讲述水利专家申天一和同窗辛远航在古木村治理黄河水患问题时，遭遇了“逆水行尸”的诡异事件，并意外搭救了昔日伙伴余茵。几人同行合力探索黄河诡事背后的真相。申天一等人在重重谜团中层层分析、逐步揭开谜底，找到了科学治理水患之法，彻底让古木村恢复了和平。

兮何年间，数万田氏族人生活的棕野岛邪恶势力横行。游侠林羽（刘衍辰 饰）听闻此事，毅然决定回到岛上平定动乱，解救曾对他有恩的田氏家族。途中，林羽偶遇身份不明的神秘女子宇露（沈雨 饰）。原来，宇露本是发起动乱的谋士高净（郭震 饰）派来迷惑林羽的，却在相处中看清孰善孰恶，并渐渐爱上林羽。一路走来，林羽遭遇各种伏击暗杀，宇露为保护林羽，差点被杀死，面冷心热的林羽渐渐被感动。最后，林羽在宇露的帮助下，经历重重机关，制服高净，田氏一族最终得救。

兮何年间，数万田氏族人生活的棕野岛邪恶势力横行。游侠林羽（刘衍辰 饰）听闻此事，毅然决定回到岛上平定动乱，解救曾对他有恩的田氏家族。途中，林羽偶遇身份不明的神秘女子宇露（沈雨 饰）。原来，宇露本是发起动乱的谋士高净（郭震 饰）派来迷惑林羽的，却在相处中看清孰善孰恶，并渐渐爱上林羽。一路走来，林羽遭遇各种伏击暗杀，宇露为保护林羽，差点被杀死，面冷心热的林羽渐渐被感动。最后，林羽在宇露的帮助下，经历重重机关，制服高净，田氏一族最终得救。

本片讲述了盛唐年间，唐王设立“界安司”震慑群妖以安国运，但宰相李林甫以铲除界安司为代价与妖王达成协议，想换取人妖两族和平共处。多年后，妖王红叶姬妄想刺杀唐皇得以妖族称霸天下，最终众人合力，妖王红叶姬惨死在界安司后裔解子墨剑下，阴谋就此落败，国恨家仇皆得报的故事。