卡巴Ⅰ成為了遺跡宇宙船的大腦，為了使遺跡基地崩壞而開始上升，而在其上，村上與吉歐展開宿命的對決！然而在激鬥後落敗的村上成為吉歐的人質，使得卡巴不得不現身，面對吉歐的神秘道具──單元．利姆巴。而此時，遺跡宇宙船也面臨其他獸神將的總攻擊…

卡巴Ⅰ成為了遺跡宇宙船的大腦，為了使遺跡基地崩壞而開始上升，而在其上，村上與吉歐展開宿命的對決！然而在激鬥後落敗的村上成為吉歐的人質，使得卡巴不得不現身，面對吉歐的神秘道具──單元．利姆巴。而此時，遺跡宇宙船也面臨其他獸神將的總攻擊…

速水用自己的生命讓卡巴Ⅰ爭取到獲勝的機會。而藉著速水的肉體，阿普頓終於真正復活，晶繼承了速水的遺志，讓他再度下定決心並且獲得與鬥志。另一方面，遭受挫折的獸神將卡布拉爾惱羞成怒，藉著增幅後的思念波，聚集並且融合同化了無數獸化兵，讓他變成奇異的最強戰鬥姿態──「巨獸神」，對卡巴Ⅰ與阿普頓展開了攻擊。面對巨大無比的對手，晶終於要解放巨人殖裝真正的力量……

與獸神將的激戰到了尾聲，歷經苦戰的巨人殖裝終於打倒了操縱雷電的普魯達。然而在已耗盡精力的晶面前，心懷不軌的三名獸神將現身，打算坐收漁翁之利。就在此時禍不單行地，卷島顎人再度強行召喚了巨人殖裝，晶因此陷入了生死一線的大危機！

晶跟速水潛入雲界之門後，終於在97樓‧等級４實驗室發現被石化的阿普頓。但是因為裝置暴走的緣故，阿普頓的肉體在晶眼前被炸成碎片。不過阿普頓的肉片在融合捕食了隱形獸化兵後再度復活。晶跟速水高興的走近，但阿普頓卻突然攻擊他們。原來阿普頓的精神已受到獸神將卡布拉爾支配。阿普頓融合吸收急忙趕來的獸化兵，漸漸變成可怕的「惡魔阿普頓」。晶跟速水深入敵陣，面臨最大的危機。另一方面，在亞利桑納地下大空洞與巴卡斯等三神將對峙的顎人，雖然對覆蓋整個空洞的獸神將瓦夫達諾斯的「臣毛」感到棘手，但他還是展開反擊……

遭受挫折的獸神將卡布拉爾惱羞成怒，藉著增幅後的思念波，聚集並且融合同化了無數獸化兵，讓他變成奇異的最強戰鬥姿態──「巨獸神」，對卡巴Ⅰ與阿普頓展開了攻擊。面對巨大無比的對手，晶解放了巨人殖裝真正的力量，成為了「真正的巨人」！兩大巨人激戰的結果是……？

在與卡巴壯烈至極的戰鬥中，失去了多名獸神將的克諾斯十二神將，以及未知的全新威脅，將掀起更加混沌的波瀾!?連載突破了25年的強殖裝甲最新刊登場!!!

在阿普頓的幫助之下，晶總算逃出了獸神將的魔掌。但是阿普頓卻不幸地落入了卡布拉爾的手中。而在普魯達死後，接管了日本分部的辛與巴卡斯博士對庫爾梅克等三名獸神將的懷疑更是加深。而另一方面，阿卡菲爾為了使村上征樹從昏迷中甦醒，獨力駕駛方舟將方舟內蓄積之能量轉移給村上征樹，而耗盡力量的阿卡菲爾再度陷入了沉眠…

少年深町晶在某個巧合之下接觸到神秘的「單元‧Ｇ」，意外成為了遠古時期外星人所留下的強殖裝甲「卡巴」的殖裝者，但是這一切卻是一連串悲劇和戰鬥的開始!?外星人的遺產「強殖裝甲－－卡巴」與想奪回強殖裝甲的神秘組織「克諾斯」之間的悲壯戰鬥！

為了救出被克諾斯帶走的瀨川兄妹及父親，深町及村上深入克諾斯的遺跡基地──魅奈神山。然而等待著他們的是獸化兵的菁英──超獸化兵５人組！在強敵面前，連善戰的卡巴Ⅲ也敗下陣來，深町更因控制金屬遭受電擊而陷入戰鬥不能的狀況。在好不容易逃出敵陣之後，等待著深町的卻是更殘酷的地獄!?