一处环境极其恶劣的露天作业场，羸弱不堪的操作工日村纪久生（洼冢洋介 饰）饱受感冒的困扰，他为此还遭受同僚的谩骂和欺负。关键时刻，酒吧的妈妈桑鲇川樱子（小西真奈美 饰）将日村回自己的公寓，随后将其送到了病毒学权威一之濑迅教授（柄本明 饰）所在的医院治疗。但在某个寂静的夜晚，日村竟趁人不备溜出了医院。原来他的真实身份是一名天才科学家，此前他研发了可对对治世界上了百多种感冒病毒的特效药，但却因某种原因带着原始数据逃亡。某神秘组织觊觎特效药的潜在价值，因此接二连三出手试图找到日村的行踪。 　　传说中的仙丹妙药，引发了丧失人性的争夺……

小説家の私（本木雅弘）は、妻の春子（安藤サクラ）と４歳の娘・左枝子、二人の女中とともに暮らしており、娘の健康に対して臆病なほど神経質である。娘には夏でも風邪を引かぬように厚着をさせる。外で人が娘に対し物を食べさせようとすると、腹痛を起こすかも知れぬから絶対拒否等々。左枝子の前の子を流行り病で亡くしており、当然の帰結・徹底だと思っている。 　　時は、大正7年（1918）秋。流行感冒（スペイン風邪）が流行り感染者が増える中、女中の石（古川琴音）が、よりにもよって村人が大挙集まる旅役者の芝居興行を見に行ったのではないか、という疑念が沸き上がった。 　　石は普段から少し愚鈍に見え軽率な行為も多い女中であった。彼女ならやりそうな事だと問いただしたが、石は行ってないと言う。が、私は、そんな疑念を日頃から起こさせる彼女をこの機会に辞めさせようと思った。 　　大騒動となったが、妻の春子はそんな理由で辞めさせては世間体が悪いと言い、私に冷ややかな眼差しを向けた。 　　私は暴君になった心持ちがし、石を辞めさせることを思いとどまるのだが・・・。

同じ作業（細胞分裂）を繰り返すだけの毎日に飽き飽きしていた一般細胞の前に、ステキな帽子をかぶった謎の細胞が現れる。その細胞は白血球（好中球）やキラーT細胞らにいたずらを仕掛けようと一般細胞を誘う。日頃のうっぷん晴らしをして楽しむ一般細胞。だが、このステキな帽子をかぶった細胞はいったい何者なのか……？