昭和29年の「ゴジラ」でスタートした東宝の怪獣映画シリーズは、「モスラ」や「妖星ゴラス」などの傑作を生み出し、また「大怪獣ガメラ」や「大巨獣ガッパ」など他社の怪獣ものにも影響を与え、海外にも多くのゴジラ・フリークを生み出した。しかしそのマンネリ化は防ぎようもなく、昭和40年代に入ったあたりから初期の頃のヒューマンな味わいが薄れ、怪獣同士の戦いがメインの子供向け作品に移行していく。この作品はそれまでの東宝怪獣キャラクターが勢ぞろいして怪獣島に管理され、平和な生活を送っているという状況で物語が始まる。そこに宇宙から凶悪怪獣キングギドラが飛来し、地球怪獣との死闘が……。

沙鲁奈公主乘机前往日本途中，飞机突然爆炸，唯公主一人得以生存並降落地球，可是其意识转为有预言能力的金星人，这金星人的使命就是要拯救將要灭亡的地球，金星的文化科学被宇宙怪兽 奇古度拉破坏，奇古度拉的下一目标就是地球，可是地球怪兽哥斯拉跟拿顿卻互相仇恨，并沒有助人类的打算，魔斯拉唯有出动苦力，望说服他俩对抗奇古度拉。

小高源吾是个喜爱怪兽的漫画家，但是自己所创作的怪兽往往不被自己的上司所欣赏，某天一个怪兽游乐园的人看中了他的作品于是雇用了小高，起初小高还很高兴的接下了这项工作，但是在过程当中却不断的发生奇怪的事情，也因此使得在怪兽岛的哥吉拉派遣安基拉斯来到日本，结果小高发现这居然是一场阴谋，而且这个阴谋正是以哥吉拉跟地球为目标.......

沙鲁奈公主乘机前往日本途中，飞机突然爆炸，唯公主一人得以生存並降落地球，可是其意识转为有预言能力的金星人，这金星人的使命就是要拯救將要灭亡的地球，金星的文化科学被宇宙怪兽 奇古度拉破坏，奇古度拉的下一目标就是地球，可是地球怪兽哥斯拉跟拿顿卻互相仇恨，并沒有助人类的打算，魔斯拉唯有出动苦力，望说服他俩对抗奇古度拉。

来自美国《世界新闻》报社的记者斯蒂芬·马丁（雷蒙德·波尔 Raymond Burr 饰）乘飞机前往开罗，在东京转机期间却遭遇令他永生难忘的事情。日本方面一艘打捞船突然与陆地失去联系，前往救援的船只也不幸遇难。从幸存者的口中世人得知，这些遇难船遭到了恐怖的怪物哥斯拉的袭击。著名古生物学家山根京平博士对遭遇袭击的大户岛进行勘查，证实哥斯拉实为两百万年前侏罗纪时代存活下来的恐龙，由于受到原子弹的辐射和氢弹试验的影响而发生突变，并重现人间。人类面临空前的灾难，斯蒂芬成为了这场灾难的见证者…… 　　本片根据香山滋的科幻小说改编，该版本为美国重新剪辑并在国内公映的版本。

二十世纪最后的夏天。那一天人类第一次知晓，自己并非地球唯一的支配者。地球上出现了巨大生物“怪兽”和能够驱逐怪兽的强大的存在——“哥斯拉”。和怪兽的战斗持续了半个世纪，人类不断失败和逃亡，最终不得已实施了逃离地球的计划。2048年，由中央政府管理下的人工智能筛选出的人类搭乘恒星移民船“阿拉特拉姆”号向11.9光年外的“鲸鱼座塔e星”前进。但是，历经长达20年的旅程终于到达的塔e星与地球的环境比预计的还要恶劣，并不适合人类的存续。另一方面，搭乘移民船的青年——晴生，曾在4岁时亲眼目睹双亲被哥斯拉杀害，20年间一直在研究如何打倒哥斯拉并夺回地球。当得知移民的可能性已不存在时，生存环境日益恶劣的船内，以晴生为中心的“回归地球派”人数渐增，并决定展开危险的长距离亚空间移动，重回地球。然而，他们所回到的是经历了2万年的岁月后的地球，已形成了以哥斯拉为顶点的生态系统的未知世界。究竟人类能否夺回曾经属于自己的星球，晴生的命运又会如何……

地球遭到哥斯拉的毁灭，Haruo的父母被杀害，他作为被选中的一员，逃离到了外星球。但新行星并没有适合人类的生存环境，于是被选中的人类只能折返。然而回到地球后，这里已经是2万年之后的世界了。人类与哥斯拉陷入了一场你死我亡的激烈决战......

游乐园放映用3D立体短片

游乐园放映用3D立体短片

二十世纪最后的夏天。那一天人类第一次知晓，自己并非地球唯一的支配者。　　　地球上出现了巨大生物“怪兽”和能够驱逐怪兽的强大的存在——“哥斯拉…