景山经济开发区副总指挥马其鸣突然被景山市委任命为下辖林河市的市委政法委书记，并被要求尽快上任。然而，他乘坐的轿车刚刚驶进林河市境内不久，就被一位叫苏紫的少妇拦截。她哭诉丈夫陶实不明不白地死在看守所，凶手童小牛却逍遥法外。女记者季小菲急于想知道苏紫拦车的结局，却被父亲老季反锁在家中。市公安局防暴大队长胡权礼向正在市内迎候马其鸣的常务副局长吴达功报告马其鸣未接苏紫的状子，这让吴达功长舒一口气。林河市公安局副局长李春江和刑警大队长曾浩一起抓捕从看守所逃跑的了解陶实案内幕的朱旺子。可是，杀手独狼抢先一步惊跑了朱旺子。百山集团董事长童百山得知朱旺子再次逃跑，勃然大怒。深夜，一把匕首从黑暗中飞向李春江家的窗户。

景山市经济开发区副总指挥马其鸣政绩斐然，却被景山地委突然调任林河市政法委书记。然而，去林河途中，马其鸣遭到苏紫的拦截，请求他查明自己的丈夫——出租车司机陶实死亡的真相。与此同时，黑恶势力派出杀手，欲置苏紫于死地。马其鸣一反常态，隐忍而又暧昧地悄然绕行。市公安局副局长李春江、报社记者季小菲等人异常失望和不满，却令以当地支柱企业百山集团公司董事长童百山和公安局常务副局长吴达功为代表的黑恶势力和腐败分子暗自得意。平静背后，马其鸣暗中秘密调查。面对巨大的压力、错综复杂的局面，在景山地委和林河市委的支持下，马其鸣等人彻底挫败了童百山等人的阴谋，令陶实案的真相大白于天下。马其鸣终于完成了铲除林河黑恶势力和腐败毒瘤的庄严使命。

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1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 　　11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……

2020年，网络对于如今人们的生活而言已经是不可或缺的一部分。但是，人类所不知道的是，在网络的另一面有着一个无限的世界——数码世界，以及居住在其中的数码兽……以首都圈为中心发生了大规模网络故障，乱闪的信号灯、乱码的室外屏幕……新闻上报道是网络恐怖袭击。故事的主人公是住在东京近郊高层公寓的小学五年级生八神太一。为了准备周末的夏令营而一个人留在家中，去涩谷的母亲和妹妹八神光乘上了一辆无法停止的电车。为了救母亲和妹妹，太一急忙赶往涩谷，当他前往车站月台的瞬间发生了不可思议的现象，太一去了数码世界！孩子们与搭档数码兽相遇，一同面对未知的“冒险”！

在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……

在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……

拓也他们到了数码世界的一个浮起的岛，这个岛上的人型数码精灵和兽型是完全对立的，人型的数码精灵帮助了拓也、友树和纯平，而兽型的数码精灵则协助辉二和泉，拓也和辉二竟就此打起上来，后来因其它数码精灵哭了起来而停此。人型的剑道兽，与兽型的小熊兽是好朋友，他们说起洞穴里有古代的数码精灵，认为如果仍然存在的，必定可解救这个岛。两种型态再次战争，拓也进化成炎龙兽......