樱田纯是一名不愿上学而长期不出家门的中学生，热衷于上网购物，喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。有一天收到一封自称是人工精灵荷里耶的来信，上…

樱田纯，一名不愿上学而长期宅在家里的中学生，热衷于上网购物，并喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。某天他收到一封奇怪的信，上面写着“上发条还是不上发条”的选项，纯在好奇心驱使下选择了“上发条”，之后房间里凭空出现了一只没有署名的神秘皮箱，里面装着一个非常美丽而且质感近似真人的少女人偶。使用木箱内的发条转动背部的开关后，人偶竟像有生命般活动起来，并向纯介绍自己：“我是真红，蔷薇少女的第五人偶。”这时，小丑布偶突然前来袭击，纯在在不明白怎么回事的情况下莫名其妙地成为了真红的媒介，结下了主仆关系。之后，另一对结下类似契约的人类和人偶出现在纯和真红面前，被称为Rozen Maiden（蔷薇少女） 的人偶们的战斗就此展开了……

时间从初中直接跳到了大学。虽然课还有去上，打工也有做，纯依然还是过着家里蹲般的生活。某日在打工的店收到退回来的一本教导如何制作人偶的神秘杂志，…

《薔薇少女 ～序曲～》作为TV动画的特別篇于2006年12月22、23日深夜播出，主角是水銀燈和真红，介绍两人从最初相遇到反目成仇的过程。共前、後兩篇。

真红将水银灯打败后，又回到了普通生活。 可是过没多久,又出现新的人偶——自称第七人偶的蔷薇水晶。 另一方面,随着金丝雀的来到，所有的蔷薇少女都到齐了，爱丽丝游戏也随之开启。 究竟蔷薇少女们会如何面对自己的命运……

七个具有生命的人偶，七个美丽夺目的少女，她们已经超越人偶的存在，拥有不变的容颜，强大的力量。但却没有一个是父亲心里最完美的爱丽丝。痛苦的罗真消身匿迹，留下的蔷薇少女们。为了见到父亲，为了得到父亲的爱，她们坚信只要将姐妹体内的蔷薇圣母聚集到一起，便可以进化成为爱丽丝。罗真制造的七个蔷薇少女的传说，最终演变成一场她们自相残杀的战斗，但是这场战斗有个美丽的名字——Alice Game。就这样作为唯一的梦想，唯一活着的理由，她们不断觉醒又不断沉睡，与不同人缔结契约，在N之梦境中不断寻找姐妹战斗。

屹立于瑞拉王国中央的魔法学院，是所有孩子们的梦想之地，故事便发生在这所神奇的学院中。森川大法师的女儿美星进入魔法学院学习后，结识了小樱、美烁、明杰、郝男等，大家成为了好朋友一起学习生活。突然有一天，学院里的心石和美星父亲森川大法师一起消失了，为了寻回心石，还父亲清白，美星与伙伴们踏上了寻找之路。

屹立于瑞拉王国中央的魔法学院，是所有孩子们的梦想之地，故事便发生在这所神奇的学院中。森川大法师的女儿美星进入魔法学院学习后，结识了小樱、美烁、明杰、郝男等，大家成为了好朋友一起学习生活。突然有一天，学院里的心石和美星父亲森川大法师一起消失了，为了寻回心石，还父亲清白，美星与伙伴们踏上了寻找之路。

一个叫欧娜丽的普通女孩，只想和其他女孩混在一起，结果在高中第一天，她被学校里三个最漂亮的女孩包围了。Yoo Na是Na Ri童年的朋友，Seon Ji是Na Ri的同…