地球聯邦政府與自護公國之間，發生了一場人類首次經歷的大規模宇宙戰爭。在戰爭的最後一年裡，人造機動武器-機動戰士正式投入到人類的戰事中。居住在宇宙植民區的一位少年嘉美尤S為反抗聯邦軍軍人而奪去新型的機動戰士 - 高達MK-II，並投身於反地球聯邦組織『奧干』的行列。被奪去高達MK-II的聯邦軍的精英分子，組織了『泰坦斯』，使用卑劣的手法，脅持了嘉美尤的父母作人質。最後，嘉美尤的父母就在他的面前慘遭毒手。站在嘉美尤旁邊的古華多羅Z納，竟就是以前自護公國的王牌馬沙，而他的夢想就是要令軍隊變得所向無敵。嘉美尤從失去父母的悲傷中重新振作，並為『奧干』作戰，他穿越了大氣層降落到地球上，並遇到一個神秘男子。原來這人就是馬沙以前的死對頭-傳奇人物亞寶?

宇宙世纪0087，随着AEUG和提坦斯之间的内战继续，卡缪遇到了一个神秘的女孩叫凤。但他与提坦斯强化人实验体第四号的相遇，让他的内心充满了痛苦。悲痛欲绝的卡缪奋力回到太空，寻找等着他的新型机动战士Z高达。与此同时，来自木星的帕普提马斯·西罗克（PaptimusScirocco）在提坦斯增加了自己的力量。第三个势力终于以轴心的 Zeon 残余的形式行动了...随着增强的画面和GACKT所作主题曲，卡缪和四的悲剧浪漫史在机动战士Z高达三部曲第二部中拉开帷幕。

宇宙世纪0153年，这个时候地球联邦已经名存实亡，统治衰颓腐朽，宇宙殖民地纷纷脱离控制，地球圈成为诸多军阀逐鹿的场所；建立于Side 2的新兴国家赞斯卡尔帝国开始对地球的侵略，联邦军根本无法阻挡，只有民间军事组织“神圣军事同盟”还在坚持抵抗。出于一个完全偶然的机会，少年胡索·艾文成为神圣军事同盟的驾驶员，被赋予了最新锐的机体，V高达……

宇宙世纪0153年，这个时候地球联邦已经名存实亡，统治衰颓腐朽，宇宙殖民地纷纷脱离控制，地球圈成为诸多军阀逐鹿的场所；建立于Side 2的新兴国家赞斯卡尔帝国开始对地球的侵略，联邦军根本无法阻挡，只有民间军事组织“神圣军事同盟”还在坚持抵抗。出于一个完全偶然的机会，少年胡索·艾文成为神圣军事同盟的驾驶员，被赋予了最新锐的机体，V高达……

第1部 激闘編 ガンダム大地に立てるか！？ 　　第2部 休日編 ジオン・ホテルの脅威？ガンダム・ペンション破壊命令！！ 　　第3部 決戦編 SDオリンピック！！スタジアム・笑いに染めて

第1部 激闘編 ガンダム大地に立てるか！？ 　　第2部 休日編 ジオン・ホテルの脅威？ガンダム・ペンション破壊命令！！ 　　第3部 決戦編 SDオリンピック！！スタジアム・笑いに染めて