龍崎跟日比野陪三島課長喝完酒在回家的途中，自行回家的課長突然遭到不明人士的攻擊還身受重傷，由於沒有被搶的痕跡，加上嫌犯沒有使用其他武器，懷疑是仇家所為，經過一番調查，果然即時在嫌犯再度犯案時順利加以逮捕。

新宿第二署的三島課長竟然有個不為人知的孩子？就在此時，發生了一起撼動警視廳的大案子。移送途中的犯人脫逃、發生了女孩綁架事件！還沒有訂出搜查方針的搜查一課陷入一片混亂。郁夫跟日比野的搭檔要如何面對這起事件？

事件過後15年，「金錶男」終於再度現身…！龍哉在激動的情緒下，獨自一人與「金錶男」對峙。這時他又知道了一個衝擊性強烈的新事實。然而，公安警察卻阻礙了他的行動。陷入險境的龍哉，起死回生的最後一步棋是…？

掃蕩秘密賭場客船的行動結束後，聖副總監因為違法搜查遭到撤職還得追究刑事責任，而龍哉為了保護郁夫而中槍落海生死未卜，龍哉則是被送進了醫院昏迷不醒。而美月為了查出項鍊裡晶片的秘密跟基小姐相約見面，豈料對方已經被公安盯上而送了命。

警視總監槍擊案已經過了一個月，但案情仍然陷於膠著毫無進展。郁夫、美月趕往新的案件現場！在伊朗人販毒集團的命案現場，郁夫跟以前在派出所執勤時的恩人重逢了！他就是人望極佳的善波巡查長…

碰上警察官連續殺人分屍事件的郁夫，正式展開搜查。種種因素與憎恨，使事件愈加複雜，但真相總算漸漸浮現。後來，當郁夫得知警界黑暗面的內幕，長眠在他內心深處的新的記憶甦醒了……！

阿龍遭到風花媽媽桑的陷害而遭到警方逮捕，另一方面郁夫找上了風花，在追問之下她坦承自己就是遭到通緝的今福和美，不過郁夫卻被她注射了肉毒桿菌造成身體麻痺，風花跟阿龍之間究竟有什麼深仇大恨，為什麼她要設計陷害阿龍呢…？

龙崎跟日比野原本是要跟踪毒贩上了公交车，结果却碰巧遇上研究生‧夏目挟持公交车的事件，他不但朝日比野开枪，原以为他要报复的对象是恩师‧桐谷，结果竟然是企图将公交车冲进桐谷的孙子所就读的开光小学，龙崎他能够化解这场危机吗……？

由於「警視總監派」跟「副總監派」互爭主導權，警視廳內部彌漫著一股不安定的氣息。這時候，竟然發生了大事件，警視總監被人槍擊了！凶手身分、犯案動機一概不明。案情陷入一片混沌，如入五里霧中。而郁夫卻在此時擅自去調查另一個案件！

郁夫跟美月同時都被調往警務部擔任「監察官」的工作，而且還是在美月的父親底下做事。來報到的第一天就遇上鷲尾管理官前來接受調查，他被懷疑協助將不當資金交給聖副總監，要求他只要供出幕後主謀就是聖副總監，就可以獲得輕判。只是狡猾的聖技高一籌，先以持有毒品的嫌疑將鷲尾逮捕。