曾经，来自海洋的神秘敌人“塞壬”向人类发起了猛烈的进攻，“碧蓝航线”的少女们凭借着她们钢铁般的意志与敌人奋勇作战，最终击败了对手，守护了人类。然而，随着时间的流逝，碧蓝航线内部因为理念的差异逐渐产生分化，衍生出了名为“赤色中轴”大的对立阵营。 　　被称为“灰色的幽灵”的最强英雄企业（石川由依 配音）、每天都迷迷糊糊但关键时刻意外的顶用的拉菲（长绳麻理亚 配音）、虽然年纪不大但成熟体贴的大黄蜂（山本希望 配音），个性好强但心地善良的哈曼（伊藤明日香 配音），面对动荡的时局，当这些少女们再一次被推上战场，会发生怎样的故事呢？

致碧蓝航线以祝福—— “碧蓝航线”的少女们，击溃了自外界入侵的神秘之敌“塞壬”的强烈攻势。 然而，斗争世世代代都未曾改变。 就如同人类曾经夺取海洋霸权一般，由于理念上的差异“碧蓝航线”与“赤色中轴”成为对立阵营。 之後，时光流逝——

这里是，空中漂浮着众多岛屿的，空之世界。在信奉神秘的赛克汀瑟岛上生活的少年·格兰，以及会说话的羽蜥蜴碧，某天，遇见了迷之美少女——露莉亚。…

为碧蓝的航线献上祝福——「碧蓝航线」的少女们，击退了从世界之外而来的神秘敌人「塞壬」的大攻势。但，战争不管到了何时，都不会有变化。正如…

二战时期，日本的军国主义海军非常强大，在当时盛极一时，昭和9年四月，江田岛海军兵学校将培育优秀的海军航空士官，这一批士官参加了袭击珍珠港的事件，最后的冲绳之战中……

20世纪30年代，日本全民备战，社会从上到下充满了亢奋情绪。农村少年平田一郎（中村吉右卫门 饰）和好友本多（岛田正吾 饰）怀着一腔热情，报考了军校，…

A cocky guy joins the Navy for the wrong reason but finds romance and twice is cited for heroism.