After the events of Ninjago: Masters of Spinjitzu (2011), the ninja: Kai, Jay, Cole, Zane, Lloyd and Nya, face even greater threats who want to disturb the peace in the land of Ninjago.

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在《乐高幻影忍者：旋风术大师》（2011 年）的事件之后，忍者们——凯、杰、科尔、赞恩、劳埃德和妮雅，面临着更强大的威胁，这些威胁企图扰乱幻影忍者世界的和平。

武艺高强的吴大师秘密训练了4位擅长幻影旋转术的幻影忍者，他们正在寻找4件威力无比的黄金幻影武器，以维护世界和平。邪恶魔王加满都和他的骷髅军团紧随其后，企图夺走武器并作恶世界。勇敢的幻影忍者们踏上征途，一路战斗、征服神龙穿行地下世界并运用强大的幻影旋转术来夺回正义的黄金武器。

The hunt is on for the UK and Ireland's best Lego builders, as some of the most skilled brick fanatics do battle

经过了十个世纪，大约在198X年的某一天，阿特姆施莱德在日本收养了义女唐井(恰巧是天狗施莱德小禄崎的直系血缘传人)，并传授了她有关忍者的一切，可能是考虑到地球科技的发展让他即将可能回到太空，所以他将唐井立为自己的继承人，并告诉了她自己是外星人的一切真相。随后跟随地球上其它逃亡阿特姆的消息，阿特姆施莱德转战来到了美国，并且很快拥有了纽约市长颁发的城市金钥匙，成为纽约最大的资产家，家财万贯，同时拥有全市最高的大厦，并且控制着整个城市的黑势力。 　　同一时间里施莱德残忍的杀害了身在美国的守护者滨户良大师，所谓守护者是地球上崇拜并保护阿特姆流亡者的战士，因为滨户良在此之前曾经几次请求讨伐过天狗施莱德的五龙忍者裁判所帮忙打败这名阿特姆施莱德，但是裁判所表示他们只关心被封印起来的天狗，认为这是施莱德个冒牌货，所以没有必要与其一般见识。这一情况惹恼了阿特姆施莱德，之后因为朋友的背叛，滨户良随阿特姆流亡者们转移逃离了日本，但终究还是在美国被杀害了。 　　侥幸逃脱的滨户良的宠物鼠斯普林特意外的与另外四只乌龟在纽约下水道沾染上了由阿特姆所制作的变异液体，变成了接近人形的变异生物，也就诞生了新一代的忍者神龟，斯普林特开始训练这些乌龟们滨户良留下的忍者功夫和知识，希望有朝一日能为自己的主人复仇。2003年的某一天，已经长大并初露锋芒的忍者神龟们终于遇到了他们的宿敌，施莱德试图拉拢神龟之一的李奥纳多为自己服务，但是惨遭失败，露出邪恶本性的阿特姆施莱德与神龟们开始了第一战，最后在斯普林特出手帮助下众人合力将其击退。过了一段日子，施莱德展开了复仇，并将李奥打成重伤，在朋友帮助下逃过，休养生息后神龟们返回纽约与施莱德展开第二次较量，最终施莱德被李奥用腾古之剑砍下脑袋，但是我们知道这只是他的机器外壳，而神龟们的代价则是失去了他们的父亲:斯普林特的踪迹……为了寻找失踪的父亲，神龟们结识了阿特姆流亡者一族并且了解了他们的历史，但是就在这时，施莱德再度出现了，一番大战后，施莱德露出了他的真面目，眼见阿特姆一族利用传送门逃离地球，千年的复仇计划毁于一旦，施莱德气急败坏的要与神龟们同归于尽，而最终神龟们利用传送门逃生，施莱德则在一片爆炸声中消失了踪迹……

四只生活在纽约下水道里的小乌龟因为有毒的放射性物质的污染，开始向他们接触最多的物种--人类“进化”，并在鼠师傅斯普林特的谆谆教导下，变成了四个最可爱、最善良、最勇敢的绿壳英雄！ 第一次走出秘密栖身的下水道，这些忍者兄弟就将面对一个奇妙又危机四伏的世界——大都市纽约。敌人比以往更强大，忍者龟们对比萨饼的热爱有增无减，他们的忍术日臻完美，搞笑功力也更有长进！

神秘而美丽的气功世界万兽山，不同的动物部落各自为营，虽然偶有冲突，但还算相安无事。沿着山脉飞流而下的泉水，带着气能量滋养着各个部落的动物们。依靠气能量，不同的能力和潜能得到激发，而公正威严的金狮部落在无敌狮的统领下，将气能量分给其他部落，以维持气功世界的安宁和平衡。可是战争无法避免，凶猛贪婪的鳄霸王率领蛮鳄部落挑战金狮部落的权威，由此引发了天鹰、大猩猩和苍狼等部落的大战争。危机不止于此，更为可怕和邪恶的蝎斯狂带领蝠锐特、毒螯蛛等黑暗势力妄图抢夺所有气能量，称霸气功世界。正义和黑暗之间的战斗一触即发…… 　　本片为乐高品牌产品的派生动画。

这是一支英勇团结的队伍，队长强袭率领巨霸、弦匠、新兵华光、清风和突波，与星云.伏恩率领的恶霸集团展开了激战，彻底粉碎了他们破坏英雄工厂从而毁灭宇宙的狂妄企图。但宇宙仍未就此平静，邪恶的火王又率领喷火恶霸们袭击英雄工厂，企图偷盗燃料并作恶世界。利用最先进的技术，英雄工厂的工程师们全新制造并升级了新一代英雄，具有高大灵活的身躯，更先进的头盔、装甲和武器，所向披靡，面对这场火的考验，新英雄们能够再次保卫英雄工厂，捍卫宇宙和平么？

家喻户晓的神话人物孙悟空将会在这一部动画系列剧中化身为“齐小天”，一个着迷于《西游记》古老传说的少年，他梦想着能成为和孙悟空一样伟大的神话英雄。