健太自幼立志成为一名神奇宝贝训练家，带着火暴兽，他从若叶镇出发，踏上了冒险的旅途。在神奇宝贝中心，健太遇见了曾经青梅竹马的玩伴玛丽娜，两人结伴而行。贪婪的火箭队想要得到自由自在生活在森林里的野生电气系神奇宝贝，他们设计了一种特殊的捕捉装置，能够将电气系神奇宝贝发出的电流无效化，有此神器在手，神奇宝贝们的灾难降临了。 　　就在事态的发展即将失去控制之时，传说中电气系神奇宝贝的守护神雷公献出了真身，然而就连强大的雷公也不敌火箭队的武器，事态的发展即将失去控制。就在此时，健太和玛丽娜挺身而出同火箭队展开了对抗。

日本播放的《宝可梦》系列动画分为不带小标题的无印篇动画和附带小标题的其他六部动画，附带小标题的6部动画在设定上根据各自的游戏版本而有所不同，并未按照季度划分。

《精灵宝可梦XY&Z》讲述主人公小智揭开从来没有任何人看到过的传说中的神兽Zygarde隐藏的秘密，并且与神秘组织“闪光团”展开激战的故事。小智的精灵甲贺忍蛙出现了不可思议的变化。

精灵宝可梦：世代是精灵宝可梦动画的短片系列，改编自每代的精灵宝可梦游戏。系列一共18集，每集长度3～5分钟，2016年9月17日（东8区时间）起每周于精灵宝可梦海外官方Youtube频道首播。

宝可梦25周年纪念动画《宝可梦进化》（Pokémon Evolutions）。讲述8个地区的训练师和宝可梦一起成长的故事。

那一天我们迈出了一步 《宝可梦 剑/盾》首部真正意义上的动画作品《破晓之翼》。 真实刻画生活在“伽勒尔地区”年轻人们苦恼与纠葛的故事即将开始。少年约翰自小就因病住进医院。他第一次通过电视实况转播观看宝可梦对战时就便成为冠军丹帝的崇拜者，一直梦想着有一天能在亲临赛场观看丹帝的比赛。故事就是从宝可梦联盟会长洛兹到访约翰疗养的医院开始的。本作品每一集都会有新的主人公。将故事串联起来的是一台飞翔出租车。少年的梦、道馆馆主们藏于内心的苦恼等，飞翔出租车今天也承载着各种各样的思绪展翅翱翔在伽勒尔的天空

小智与皮卡丘新的冒险开始了！ 新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？ 新的精灵宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！ 去吧！全力！大冒险！！

小智与皮卡丘新的冒险开始了！ 新的冒险舞台是自然资源丰富的阿罗拉地区。在阿罗拉地区这个四处都是蔚蓝的天空和蓝色的大海的地方，等待着小智和皮卡丘的是？ 新的精灵宝可梦，新的伙伴，以及新的经历……新的冒险旅程终于拉开了帷幕！ 去吧！全力！大冒险！！

精灵宝可梦，不可思议的生物。可是，还没有人了解所有的宝可梦。以成为宝可梦大师为目标，继续着旅程的小智和伙伴皮卡丘在合众地区的冒险又开始了。新…

来自真新镇的10岁少年小智以成为精灵宝可梦训练大师为目标，即将踏上修行之旅。要知道，精灵宝可梦训练师与宝可梦在冒险时总是时时刻刻在一起，可以说是共同成长的伙伴。而且在共同的生活中产生的彼此的友情力量会让宝可梦在战斗中更加强大。所以，拥有一只适合自己的宝可梦对于宝可梦训练师来说是多么重要！可是，小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选精灵宝可梦的资格，于是，他领走了一只被挑剩下的宝可梦——皮卡丘。皮卡丘虽然长相可爱，但性格内向而不亲近人类，稍有不满就乱放电，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。