杜仲是京城内的一位名医，因为医治好了慈禧太后久治不愈的疑难杂症而被破格升职为御医，迁入了紫禁城之内。成为御医之后，杜仲凭借着他聪慧的才智和高超的医术闻名于红墙之内，深得皇上和太后的信任。然而，杜仲却在被囚禁的光绪身上看到了夺目的帝王之气，并因此而卷入了残酷的政治斗争之中。杜仲家中有一妻洪百合，因其不能生育，又纳了伏苓为妾，谁知伏苓侠肝义胆，竟在洞房花烛之夜和情郎私奔，杜仲得知后写下休书成全了这对有情人。数年后，被情人抛弃的伏苓和杜仲重逢并成为了好友，两人天衣无缝的合作更是屡破奇案，久而久之便相互暗生情愫。

杜仲（郭晋安 饰）是京城有名的医生，他医好了慈禧太后（罗兰 饰）久治不愈的疑难病症，因此被破格提拔为御医，迁入紫禁城。成为御医后，杜仲凭借聪明才智和高超医术，在宫中声名远扬，深受皇上和太后信任。然而，他在被囚禁的光绪身上看到了非凡的帝王之气，从而卷入了残酷的政治斗争。 杜仲家中有妻子洪百合（贾晓晨 饰），因她无法生育，杜仲又纳了茯苓（杨怡 饰）为妾。没想到茯苓侠肝义胆，在洞房花烛夜与人私奔。杜仲为成人之美，写下休书成全了他们。几年后，被情人抛弃的茯苓与杜仲重逢并成为好友，二人合作无间，多次破解奇案，久而久之，竟真的产生了情愫。

苏毅本是远近闻名的医术大家的传人，为了夏家千金夏雨荷甘愿隐瞒身份，成为夏家的女婿，却因此遭受无数嘲讽。苏毅凭借高超的医术，救下海城唐四爷，揪出了幕后黑手，因此获得许多名人的关照。苏毅和妻子夏雨荷之间的感情多次受到苏士白和姚炳的阻碍，但两人不离不弃，一次次躲过了他们的陷害。最终，唐四爷出手相助，让姚炳再也不敢对苏毅夫妻二人动手。岳母张兰自此一改以前对苏毅的刻薄态度，苏毅也得到了夏家众人的认可。

明朝中叶，皇帝朱历登基后，处处为太后所钳制，一心想振作朝纲的他微服私访来到民间，巧遇女扮男装的“小华佗”何天心，两人一见如故。天心不知道朱历的身份，在他面前大骂当朝天子昏庸无能，朱历反被天心的率直所打动。不久，东厂总管太监李保川家中失窃，这一切正是侠盗“黑蝙蝠”张哲三所为。自此朱历与天心、哲三三人结为兄弟，一同对抗包括吏部尚书赵甫嵩、大太监李保川在内的朝中旧势力。最终在众人的帮助下，朱历战胜了各股恶势力，天心也解开了自己的身世之谜。发现了彼此真实身份的天心和朱历相爱了，但为了继续为百姓解除病痛，天心选择了留在民间，有情人虽天各一方却心心相印。

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