故事从传说中的夸克族与暗黑族开始延伸.善良与邪恶形成两势力对抗,加入「萌学园」里的萌骑士团结在一起保护结界.萌学园里的魔法预言书蕴藏著什么天大的秘密?奈亚公主及忧伤艾瑞克纯纯的情愫正在发酵,误闯萌学园的坚尼,会为萌骑士团带来什么冲击?颠覆你对魔幻世界的想像力,一起探索萌学园体验奇幻旅程.

萌学园，传说成立的时间是在地球诞生的年代，是一所由夸克族人组成的魔法学校，隐藏在地球大气层外平行空间里，并由萌骑士幻之星、炎之星、智之星、十之…

《萌學園外傳》內容是劇中人物的小秘密。

该剧围绕一名乡村女教师展开，讲述了她远离繁华都市，心甘情愿地为山村教学无私奉献的故事。 李良伟，他早年是一名知青，钟爱教育事业，把毕生的精力都投入其中。后来李良伟被城市老板展旗聘为柳崖子村小学的校长，他一直为孩子们的教育事业而废寝忘食、兢兢业业。山村的生活虽然很清贫，但他一直无悔。也正因为他是有文化的知青出身，即使是清贫也骨子里透出高贵。李良伟对自己的妻子巧云心存内疚，因为她曾是村里最美的女人，跟自己结婚后却没有享福。他对柳晓月则是心存感激，心底很希望她留在山村协助自己继续教学，但又不愿意影响她进城当老师的美好的前途。

2003年，周大荣欣喜赴越南娶妻。当时，大荣以为完成了父亲的遗愿！阿兰也以为可以像堂妹一样幸福美满，未料却事与愿违！语言不通，让她与患有精神疾病的婆婆无法沟通。避免婆媳起衝突，阿兰带著儿子搬到附近租屋，直到婆婆往生后才搬回家。大荣长期失业，家计全落在阿兰身上，为了工作及孩子，阿兰努力突破不识字问题到学校学国语，她知道终究还是要得靠自己才能扶持一个家。@爱笑聚

父亲在美珍小时候离家出走，再也没有回来，留下母亲、大哥和她。一家三口表面和睦相处，但每个人心中都各有秘密。美珍在便利店卑微地工作，每日受经理的气，只能将心神寄托在交友软件上认识的男生；大哥生意不顺，与妻子分居，却在家人面前假装恩爱；母亲为家人劳心劳力，其实仍对多年前一件令丈夫离去的事感到内疚。人有悲欢离合，他们终会意识到，相聚一刻就是最大幸福。

故事由前一部的“异界对决”拉开序幕，夸克族的未来以及萌骑士们守护夸克族的家园，宇宙和平。

萌骑士团与阇黑大战过去半年后，一颗陨石突然朝着萌学园飞来。彗星小组发现，萌骑士队长艾瑞克竟随着陨石一同坠落到了萌学园。大甜甜教员马上用治疗驶卷使救治虚弱的艾瑞克，同时联系夸特诺基地的陶格长老前来协助。 与此同时，谜亚星掉落在了地球上的夸特诺基地，还出现了魔法反转的奇特现象。通过大甜甜和亮晶晶的沟通，艾瑞克得知谜亚星落在了夸特诺基地，他急切地想了解萌骑士团其他成员的下落。然而，他又察觉到自己体内产生了奇怪的能量，最终情绪失控。

战国时代，武士疾风与僧侣醉狂为了不让具有神秘之力的宝剑落入魔界之手，接受了城主的委托，展开寻找宝剑秘密的长途之旅，途中他们遇到了美丽的少女莲华，以及其他三名来至别处的朋友一起追踪一股弥漫在森林中久久未能散去的妖气，但是等待她们的却是强大的邪恶力量......

江望月曾被丈夫顾明欺骗，顾明为骗保装瘫痪，与小三许婷联手榨干她的价值。江望月历经网暴与磨难，搜集证据揭露真相，让顾明等人受到法律制裁。之后她创业成功，与一直等待她的顾修瑾相爱结婚，收获幸福。晚年两人相守，离世后在 “归处” 重逢，最终达成生生世世的约定，圆满落幕