阿妹注定要肩負起成為世界「守護者」的使命，必須對抗各種妖魔鬼怪，以維持魔法與人類之間的平衡。

前篇－－原水爆の実験による被害は、単に地球上のみに止まらず星世界にも及んでいた。そこで星世界では宇宙人会議を開いた結果、地球に実験中止の呼びかけのために使者を出すことにした。エメラルド彗星のスーパージャイアンツが選ばれた。彼は鋼鉄の体を持っている。群星を縫って遥か地球に向い超音速で飛んで来たジャイアンツは、地球到着間際に嵐で遭難した旅客機を救ったが、彼の腕にはめた地球計のガイガーが無気味に鳴った。その機内には日本に向うメラネシヤ経済親善使節団の一行が同乗していたが、その中の一人の鞄の中に原爆用Ｘ14ウラニウムが入っているのだ。これを知ったジャイアンツは、羽田から高級車に乗ったその男の後を追った。ジャイアンツの尾行に気づいたその男は、ある空地に車を止めピストルを発射したが、弾は空しくジャイアンツの胸ではね返るのみであった。その間に、この争いを物蔭でみていた数人の子供たちが自動車の傍らに投げ出された革鞄をひろって逃げた。イマヌエル教会の附近まで逃げて来た子供たちは嵐の如く音もなくそこに姿を現わしたジャイアンツに驚きの眼をみはったが、優しいジャイアンツといつか仲良しになった。その時、夕飯の用意が出来たとイマヌエル教会から子供たちを呼びに来た敏子は、弘の姿がみえぬのに気づいた。ジャイアンツは弘があの男に誘拐されたことに気づくと、元の宇宙人の姿に変わって空中に舞上り、メラネシヤ大使館に監禁されていた弘を救い出した。だが、その頃、イマヌエル教会では、神父をはじめ敏子や子供たちがアトムＡＢ団の乾分たちに革鞄の在りかを白状しろとピストルをつきつけられていた。後篇－－弘を助けて教会に帰って来たジャイアンツは、敏子から革鞄がアトム団によって持ち去られたことを聞くと、その跡を迫って空を飛び、やがてアトム団の疾走する自動車に追いついたが、運転している男が何者かに殺され、革鞄の姿は消えていた。メラネシヤ大使の告発でジャイアンツが殺人の容疑者にされた。だが、警視庁の岡本刑事は大使の告発に不審な点があると、大使館を秘密裡に捜査することになった。一方、アトム団は秘密の発覚を恐れ敏子を観音岬の本拠に拉致し、教会に神父と子供たちを監禁した。その頃メラネシヤ大使館では日本との親善パーティを開き政府高官を招待して、その席上ボース爆弾の完成を発表して日本に無条件降服をさせようと計画した。その間、岡本刑事は教会を脱出し助けを求めて来た正雄の言葉からアトムＡＢ団はメラネシヤ大使の組織する陰謀団であることを確認した。パーティの日、岡本刑事らは大使館を厳重に警戒した。その頃、メラネシヤ大使はボース爆弾の完成を発表し驚く日本の大臣たちに無条件降服を命令しているところに、ジャイアンツが現われＸ14ウラニウムと機密設計図を取出し、ボース爆弾の完成を阻止したと宣言した。ヘリコプターに乗って逃げるアトム団を追ってジャイアンツは敵の本拠に乗込み、敏子を救い出すと共にアトム団を撲滅した。そして、世界平和のために原水爆を持っている外国に使用禁止の話合いに行く使命が終ったら、再び必ず日本に戻ってくると敏子や正雄たちに約束して美しい夜空の星の彼方に飛び去って行った。

在与恩兹华斯的激烈战斗之后，众人获得了短暂的喘息空间。 伊莉雅一行人在救出美游之后，从平行世界的卫宫士郎口中得知美游的过去，以及在这个世界中发动的“圣杯战争”。 那不仅仅只是美游的悲惨命运，更是哥哥士郎为了美游而赌上性命，进行一场壮烈战斗的伟大故事。 为了拯救人类，恩兹华斯决定牺牲美游。 为了保护美游，士郎不惜与世界以及恩兹华斯为敌。 面对相互对立的两种正义…，伊莉雅立誓要找出方法，守护这一切！ 为了创造能与伙伴共同欢笑的未来，魔法少女们的战斗将再次展开。

平凡的中学生鹿目圆（悠木碧 配音）有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和 配音）的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇出现了，小圆在路边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类的语言。它告诉小圆它的名字叫丘比（加藤英美里 配音），并且提出了一个特殊的要求，它希望小圆能够和它签订契约成为魔法少女。 　　魔法少女是这个世界中一种特殊的存在，她们肩负着和魔女战斗的使命，作为报酬，丘比可以实现她们任意的一个愿望。在战斗的过程中，小圆发现魔法少女这个职业并非故事里所描绘的那么美好，随时有着牺牲的可能。并且，随着战斗的升级，一个关乎于她自己的残酷真相正在逐步的浮出水面。

就读初中二年级的鹿目圆，过着平凡幸福的生活。神秘转学生晓美焰的出现，开始让小圆的命运有了巨大转变。某日一只名为丘比的神秘生物，希望小圆能够与它…

艾可魔法少女由音乐，魔法，美少女三大元素构成，主要讲述了3位新海学院6年级的转学生，其实是来自神秘乐之世界的音乐魔法少女，她们在暗中对抗着邪恶的噪音魔王，悄悄的维护着世界的安宁与和平。

卯野咲是个很普通的女孩子，有一天回家的时候，发现有个怪异模样的男子正在踢门。 而令人意想不到的是，这个男子跟她的母亲居然是旧识，并且母亲还坦言了自己曾经做过魔法少女的事实。 经过解释，这名凶恶的男子居然是前来找咲代替母亲签订魔法少女契约。 获悉此事，咲一开始很不情愿，结果面对敌人来袭的时候她被迫变身，但出现在大家面前的居然是个肌肉饱满的纯爷们？！

艾可魔法少女由音乐，魔法，美少女三大元素构成，主要讲述了3位新海学院6年级的转学生，其实是来自神秘乐之世界的音乐魔法少女，她们在暗中对抗着邪恶的噪音魔王，悄悄的维护着世界的安宁与和平。

WOWOWで2001年7月5日から9月27日まで放送された。全12話。 　　監督 - 須永司 　　シリーズ構成 - 植田浩二、高寺彰彦 　　キャラクターデザイン・総作画監督 - 数井浩子 　　美術監督 - 渋谷幸弘 　　色彩設計 - 谷本千絵 　　撮影監督 - 坂本竜馬 　　編集 - 瀬山武司 　　音響監督 - 亀山俊樹 　　音楽 - 七瀬光 　　プロデューサー - 杉田敦、横山真二郎 　　アニメーションプロデューサー - 白井勝也 　　アニメーション制作 - TNK・マッドハウス 　　製作 - バンダイビジュアル、電通