因為中了超的陷阱，而跑到魔法已經穿幫之世界的涅吉等人，為了讓世界恢復原狀，利用世界樹的魔力與仙后座回到校慶最後一天，準備與超展開決戰！這時候，涅吉想出一個驚人的作戰…這個作戰到底是什麼呢？

參加畢業旅行的三年A班，這回在住宿飯店造成騷動！因為新聞社突擊訪問班成員•朝倉和美提出「嘴唇爭奪戰」！讓三年A班的同學們為了爭奪涅吉老師的吻，而騷動不斷！這些活潑、好動的同學們，將會在京都與奈良引發什麼樣的事件呢？

一直在猶豫是否要學習黑暗魔法的涅吉終於下定決心要學習黑暗魔法。但是沒想到修行的過程非常艱辛，還一度讓涅吉有生命危險。另一方面，失去記憶的夕映為了找回記憶，決定前往奧斯提亞。但是要前往奧斯提亞，就必須先通過選拔考試…

「麻帆良祭」的第一天開始了！麻帆良祭是個不只中學部會參加，連高中部、大學部裡所有的機關都會參加的超大型活動。解救行程排到滿檔的涅吉，所使用的奇蹟道具到底是什麼呢？2005年7月已經上市。

為了能夠成為優秀的魔法師，涅吉每一天都非常努力教導。而校長出了一個課題給涅吉：「如果你能夠在期末考讓班上不再是最後一名，就可以成為正式的老師……！」。面對這一次的課題涅吉將如何通過考驗呢？

在面對前所未見的強悍敵人以及遇到可靠的夥伴，涅吉將會有什麼樣的成長呢？而「Thousand master」的秘密到底是什麼呢…？與夥伴訂下的暫定契約又是什麼呢…？

混亂的畢業旅行終於結束了，三年Ａ班的同學們回到久違的麻帆良學園了。在畢業旅行時遇上的敵人，讓涅吉開始調查線索……。麻帆良學園裡到底隱藏什麼祕密呢……？2004年11月已經上市。

與明日菜失散一段時間的涅吉終於在奧斯提亞與明日菜等人會合，涅吉小組的成員也大部分都已經會合，失去記憶的記憶也已經抵達奧斯提亞。裕奈與蒔繪也在眾人的幫助下抵達奧斯提亞。就在這個狀況下，祭典正式展開了。但就在這個，涅吉等人接到快要抵達奧斯提亞的和香在路上遭到強悍的賞金獵人集團攻擊的消息…

菲特前來與涅吉談判。菲特提出的內容居然是只要涅吉等人不再插手管自己以後做的事情，就把眾人安然送回麻帆良學園。本來涅吉差一點答應這個條件，但是在明日菜的訓斥之下，決定與菲特等人正式開戰！就在涅吉小組對菲特宣戰之後，拉坎也找機會把以前與納吉等人一起經歷過的事情說出來，這時候出現了一個關鍵人物…

涅吉的青梅竹馬─阿妮亞來到日本了！看到涅吉身邊有很多漂亮大姊姊的阿妮亞，深怕這個環境對涅吉的修行會有影響，急著要帶涅吉回威爾斯。在經過一陣騷動之後，阿妮亞也決定與涅吉魔社的成員們一起行動。涅吉魔社的成員與阿妮亞一起回到威爾斯後，立刻啟程前往魔法世界。沒想到卻有個熟悉的敵人出現…